Louvain算法进行聚类 python算法
时间: 2023-07-08 18:54:10 浏览: 233
在Python中实现Louvain算法进行聚类,可以使用`python-louvain`库。这个库提供了一种简单的方式来执行Louvain算法并得到网络的社区结构。
以下是一个使用`python-louvain`的示例代码:
```python
import networkx as nx
import community
# 创建一个无向图
G = nx.Graph()
# 添加节点和边
G.add_edge(1, 2)
G.add_edge(2, 3)
G.add_edge(3, 4)
G.add_edge(4, 2)
G.add_edge(4, 5)
G.add_edge(5, 6)
G.add_edge(6, 4)
# 执行Louvain算法
partition = community.best_partition(G)
# 输出社区划分结果
print(partition)
```
在这个示例中,我们首先创建了一个无向图,并添加了一些节点和边。然后,我们使用`community.best_partition()`函数执行Louvain算法,并将结果存储在`partition`变量中。最后,我们打印出社区划分的结果。
`partition`变量存储了一个字典,其中键是节点的标识符,值是该节点所属的社区的标识符。例如,如果节点2和4属于同一个社区,那么`partition[2]`和`partition[4]`将具有相同的值。
这是一个简单的示例,你可以使用更复杂的网络和数据集来执行Louvain算法进行聚类。
相关问题
生成一个随机的二维数据集,用python实现K-Means算法的数据节点的聚类可视化,不同聚类使用不同颜色显示,设定聚类数目为5,并要求使用louvain算法将节点连接,节点间用黑线段连接,给出代码
好的,以下是生成随机二维数据集并使用K-Means和Louvain算法进行聚类可视化的代码:
```python
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.cluster import KMeans
import networkx as nx
import community
# 生成随机二维数据集
np.random.seed(0)
n_samples = 1000
X = np.random.randn(n_samples, 2)
# 使用K-Means算法进行聚类
kmeans = KMeans(n_clusters=5, random_state=0).fit(X)
labels = kmeans.labels_
# 使用Louvain算法将节点连接
G = nx.Graph()
G.add_nodes_from(range(n_samples))
for i in range(n_samples):
for j in range(i+1, n_samples):
weight = np.exp(-np.sum((X[i]-X[j])**2))
G.add_edge(i, j, weight=weight)
partition = community.best_partition(G)
colors = [partition[i] for i in range(n_samples)]
# 绘制聚类可视化图
fig, ax = plt.subplots()
ax.scatter(X[:, 0], X[:, 1], c=colors)
for i in range(n_samples):
for j in range(i+1, n_samples):
if G.has_edge(i, j):
ax.plot([X[i, 0], X[j, 0]], [X[i, 1], X[j, 1]], color='black', alpha=G[i][j]['weight'])
plt.show()
```
在上述代码中,我们首先使用`numpy`库生成了一个包含1000个点的随机二维数据集。然后使用`sklearn.cluster`库中的`KMeans`算法对数据进行聚类,将聚类结果保存在`labels`变量中。接着使用`networkx`库生成一个无向图,将数据集中的点作为节点,并根据节点之间的欧几里得距离计算边的权重。最后使用`community`库中的`best_partition`函数对图进行划分,将每个节点所属的社区保存在`colors`变量中。最后使用`matplotlib`库绘制聚类可视化图,其中点的颜色表示所属的社区,边的颜色和透明度表示两个节点之间的连接强度。
根据数据集facebook_combined.txt.gz进行Facebook社交网络中关键节点的识别,不同于传统的中心性指标模型、基于图机器学习的Node2Vec算法、Louvain聚类算法以及图神经网络(GNNs)的模型代码,请提出一个创新模型并生成完整代码
在处理Facebook社交网络数据集(facebook_combined.txt.gz)以识别关键节点时,我们可以设计一个结合了社区检测、深度学习和注意力机制的创新模型。这里,我们将利用Transformer架构的变种——Graph Attention Networks (GAT) 来捕捉节点间的复杂依赖,并集成社区信息以增强节点重要性的评估。
以下是一个基本的Python代码示例,使用PyTorch和DGL(Deep Graph Library)库:
```python
import torch
import dgl
import gzip
from torch_geometric.data import Data, DataLoader
from dgl.nn.pytorch import GATConv
from sklearn.cluster import Louvain
# 1. 数据预处理
def load_data(file_name):
with gzip.open(file_name, 'rt') as f:
data = []
for line in f:
edge_list = [int(x) for x in line.strip().split()]
src, dst = edge_list[0], edge_list[1:]
data.append((src, dst))
return data
# 2. 使用GAT模型
class KeyNodeDetector(torch.nn.Module):
def __init__(self, num_features, num_classes, num_heads=8):
super(KeyNodeDetector, self).__init__()
self.conv1 = GATConv(num_features, 8, heads=num_heads)
self.conv2 = GATConv(8 * num_heads, num_classes)
def forward(self, graph, features):
x = self.conv1(graph, features)
x = torch.relu(x)
x = F.dropout(x, p=0.6, training=self.training)
x = self.conv2(graph, x)
return F.log_softmax(x, dim=-1)
# 3. 定义训练函数
def train(model, loader, optimizer, device):
model.train()
for data in loader:
data = data.to(device)
optimizer.zero_grad()
out = model(data.graph, data.x)
loss = F.nll_loss(out[data.y], data.y)
loss.backward()
optimizer.step()
# 4. 主程序
def main():
# ...加载数据、预处理、将数据转化为DGLGraph对象等...
model = KeyNodeDetector(num_features=...,
num_classes=..., # 社区数,可以先通过Louvain算法得出
num_heads=8).to(device)
optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=0.005)
louvain = Louvain() # 初始化Louvain聚类
clusters = louvain.fit_predict(adjacency_matrix) # 获取初始社区划分
# 划分训练集和测试集
train_loader, test_loader = ...
for epoch in range(epochs):
train(model, train_loader, optimizer, device)
key_nodes = predict_key_nodes(model, test_loader, device) # 根据GAT预测的关键节点
...进一步分析关键节点对社区结构的影响...
if __name__ == "__main__":
main()
#
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