min_nonzero = min(data[nonzero(data)])
时间: 2023-03-28 17:00:59 浏览: 165
答案是:这个问题是关于 Python 编程的,min_nonzero 是一个变量名,data 是一个数组,nonzero(data) 是一个函数,返回 data 中非零元素的下标,min(data[nonzero(data)]) 表示在 data 中非零元素中的最小值。
相关问题
import numpy as np def replacezeroes(data): min_nonzero = np.min(data[np.nonzero(data)]) data[data == 0] = min_nonzero return data # Change the line below, based on U file # Foundation users set it to 20, ESI users set it to 21 LINE = 20 def read_scalar(filename): # Read file file = open(filename, 'r') lines_1 = file.readlines() file.close() num_cells_internal = int(lines_1[LINE].strip('\n')) lines_1 = lines_1[LINE + 2:LINE + 2 + num_cells_internal] for i in range(len(lines_1)): lines_1[i] = lines_1[i].strip('\n') field = np.asarray(lines_1).astype('double').reshape(num_cells_internal, 1) field = replacezeroes(field) return field def read_vector(filename): # Only x,y components file = open(filename, 'r') lines_1 = file.readlines() file.close() num_cells_internal = int(lines_1[LINE].strip('\n')) lines_1 = lines_1[LINE + 2:LINE + 2 + num_cells_internal] for i in range(len(lines_1)): lines_1[i] = lines_1[i].strip('\n') lines_1[i] = lines_1[i].strip('(') lines_1[i] = lines_1[i].strip(')') lines_1[i] = lines_1[i].split() field = np.asarray(lines_1).astype('double')[:, :2] return field if __name__ == '__main__': print('Velocity reader file') heights = [2.0, 1.5, 0.5, 0.75, 1.75, 1.25] total_dataset = [] # Read Cases for i, h in enumerate(heights, start=1): U = read_vector(f'U_{i}') nut = read_scalar(f'nut_{i}') cx = read_scalar(f'cx_{i}') cy = read_scalar(f'cy_{i}') h = np.ones(shape=(np.shape(U)[0], 1), dtype='double') * h temp_dataset = np.concatenate((U, cx, cy, h, nut), axis=-1) total_dataset.append(temp_dataset) total_dataset = np.reshape(total_dataset, (-1, 6)) print(total_dataset.shape) # Save data np.save('Total_dataset.npy', total_dataset) # Save the statistics of the data means = np.mean(total_dataset, axis=0).reshape(1, np.shape(total_dataset)[1]) stds = np.std(total_dataset, axis=0).reshape(1, np.shape(total_dataset)[1]) # Concatenate op_data = np.concatenate((means, stds), axis=0) np.savetxt('means', op_data, delimiter=' ') # Need to write out in OpenFOAM rectangular matrix format print('Means:') print(means) print('Stds:') print(stds)解析python代码,说明读取的数据文件格式
这段代码是一个用于读取数据文件的 Python 脚本。它包含了两个函数:`read_scalar(filename)` 和 `read_vector(filename)`,并使用了 `replacezeroes(data)` 函数来替换数组中的零值。脚本读取名为 `U_1`, `U_2`, ..., `U_6` 的文件,并根据文件中的数据生成一个包含各个高度的数据集。
函数 `read_scalar(filename)` 用于读取标量数据文件。它打开给定的文件,读取指定行数的数据,并将其存储在一个 NumPy 数组中。函数 `read_vector(filename)` 用于读取包含 x 和 y 分量的矢量数据文件。它也打开给定的文件,读取指定行数的数据,并将其存储在一个 NumPy 数组中。
在脚本的主程序中,一共读取了 6 个名为 `U`, `nut`, `cx`, `cy`, `h` 的文件,并将它们的数据分别存储在 `total_dataset` 列表中。然后,通过使用 NumPy 的函数将列表中的数据合并成一个包含 6 列的数组。最后,将合并后的数据保存为 `Total_dataset.npy` 文件,并计算并保存数据的均值和标准差。
这段代码假设数据文件的格式为文本文件,每行包含一个数据值。
逐句解释这段代码:def kmeans(data, k): #样本数 num = data.shape[0] #初始质心 centers = initCenters(data, num, k) # 第一列:样本属于哪个簇 第二列:样本跟它所属簇的误差 clusterAssment = mat(zeros((num, 2))) clusterChanged = True while clusterChanged: clusterChanged = False #循环每一个样本 for i in range(num): print(i) # 最小距离 min_distance = 100000.0 # 定义样本所属的簇 minIndex = 0 # 循环计算每一个质心与该样本的距离 for j in range(k): distance = euclDistance(centers[j, :], data[i, :]) # 如果计算的距离小于最小距离,则更新最小距离 if distance < min_distance: min_distance = distance # 更新最小距离 clusterAssment[i, 1] = min_distance # 更新样本所属的簇 minIndex = j # 如果样本的所属的簇发生了变化 if clusterAssment[i, 0] != minIndex: # 质心要重新计算 clusterChanged = True # 更新样本的簇 clusterAssment[i, 0] = minIndex # 更新质心 for j in range(k): # 第j个簇所有的样本所在的索引 index_j = np.nonzero(clusterAssment[:, 0] == j) # 第j个簇所有的样本点 points_index = data[index_j] # 计算质心 centers[j, :] = np.mean(points_index, axis = 0) return clusterAssment
这段代码实现了 k-means 聚类算法,下面逐句解释:
```
def kmeans(data, k):
#样本数
num = data.shape[0]
#初始质心
centers = initCenters(data, num, k)
# 第一列:样本属于哪个簇 第二列:样本跟它所属簇的误差
clusterAssment = mat(zeros((num, 2)))
clusterChanged = True
while clusterChanged:
clusterChanged = False
#循环每一个样本
for i in range(num):
print(i)
# 最小距离
min_distance = 100000.0
# 定义样本所属的簇
minIndex = 0
# 循环计算每一个质心与该样本的距离
for j in range(k):
distance = euclDistance(centers[j, :], data[i, :])
# 如果计算的距离小于最小距离,则更新最小距离
if distance < min_distance:
min_distance = distance
# 更新最小距离
clusterAssment[i, 1] = min_distance
# 更新样本所属的簇
minIndex = j
# 如果样本的所属的簇发生了变化
if clusterAssment[i, 0] != minIndex:
# 质心要重新计算
clusterChanged = True
# 更新样本的簇
clusterAssment[i, 0] = minIndex
# 更新质心
for j in range(k):
# 第j个簇所有的样本所在的索引
index_j = np.nonzero(clusterAssment[:, 0] == j)
# 第j个簇所有的样本点
points_index = data[index_j]
# 计算质心
centers[j, :] = np.mean(points_index, axis = 0)
return clusterAssment
```
- `data`:输入的聚类数据,是一个二维数组,每一行表示一个样本,每一列表示一个特征。
- `k`:预设的聚类簇数。
- `num`:输入数据的样本数量。
- `centers`:初始的聚类中心,通过 `initCenters` 函数随机生成。
- `clusterAssment`:一个二维矩阵,第一列表示每个样本所属的聚类簇编号,第二列表示该样本距离所属簇的距离误差。
- `clusterChanged`:表示聚类结果是否发生变化,若为 `True`,表示需要继续迭代聚类过程,否则表示聚类已经结束。
- `for i in range(num):`:循环遍历每个样本。
- `min_distance`:表示当前样本到其所属聚类簇的距离误差。
- `minIndex`:表示当前样本所属聚类簇的编号。
- `for j in range(k):`:循环遍历每个聚类簇。
- `euclDistance`:计算两个向量之间的欧氏距离。
- `if clusterAssment[i, 0] != minIndex:`:判断当前样本是否需要重新分配到新的聚类簇中。
- `for j in range(k):`:循环遍历每个聚类簇。
- `np.nonzero(clusterAssment[:, 0] == j)`:返回所有属于第 `j` 个聚类簇的样本的索引。
- `np.mean(points_index, axis = 0)`:计算所有属于第 `j` 个聚类簇的样本的均值,得到新的聚类中心。
- `return clusterAssment`:返回最终的聚类结果。
阅读全文