这段话什么意思1. IGV角度修正后的排气温度控制基准值(TTRXB) 排气温度控制设定基准值(TTRXSP):燃烧调整偏置修正的温度控制最小基准值(TTR_MINA) 排气温度控制设定基准值(TTRXSP)经过速率限制(1.5℉/s)和上、下幅限制(0,2048)后输出排气温度控制基准值(TTRX) IGV角度修正后的排气温度控制基准值(TTRXB):排气温度控制基准值(TTRX)+IGV开度对温度偏置的修正值(CSRGVTXB) 说明:IGV开度对温度偏置的修正值(CSRGVTXB):IGV开度余量(85-IGV开度)*3后,经过速率限制(2℉/s)和上、下幅限制(0,30)后输出
时间: 2023-10-22 19:09:35 浏览: 53
这段话主要是描述一个控制系统中与排气温度相关的参数和计算过程。其中,TTRXB是经过IGV角度修正后的排气温度控制基准值,TTRXSP是排气温度控制设定基准值,TTR_MINA是燃烧调整偏置修正的温度控制最小基准值。TTRXSP经过速率限制和幅限制后输出TTRX,而TTRXB是在TTRX的基础上加上了IGV开度对温度偏置的修正值。这个修正值的计算过程中包括了IGV开度余量的计算,以及速率限制和幅限制的处理。
相关问题
二代测序数据处理数据质量控制
二代测序数据处理中的数据质量控制是非常重要的步骤,它可以有效地提高后续分析的准确性和可靠性。以下是常见的二代测序数据处理数据质量控制步骤:
1. 质量评估:使用 FastQC 等工具对原始数据进行质量评估,检查数据的读长、GC含量、碱基质量分布等。
2. 过滤低质量数据:使用 Trimmomatic、Fastp 等工具对原始数据进行过滤,去除低质量的读段和低质量碱基。
3. 去除接头序列:使用 Cutadapt、Trimmomatic 等工具去除接头序列。
4. 消除PCR重复:使用 Picard 等工具消除PCR重复,以减少测序偏差。
5. 比对到参考基因组:使用 BWA、Bowtie2 等工具将过滤后的数据比对到参考基因组。
6. 修正碱基误差:使用 GATK、SAMtools 等工具对比对结果进行碱基质量校正,修正碱基误差。
7. 检测变异位点:使用 GATK、VarScan 等工具对比对结果进行变异位点检测,获取样本的SNP和InDel信息。
8. 进行注释和过滤:使用 ANNOVAR、SnpEff 等工具对变异位点进行注释和过滤,筛选出具有生物学意义的位点。
9. 结果可视化:使用 IGV、UCSC Genome Browser 等工具对数据进行可视化,帮助研究者更好地理解数据。
以上步骤仅为常见的二代测序数据处理数据质量控制步骤,具体步骤根据实际情况会有所不同。
samtools 如何对排序的文件建立IGV可以用的bai索引文件
要对排序后的BAM文件建立IGV可以使用的bai索引文件,可以使用samtools命令进行索引。具体步骤如下:
1. 首先,使用samtools sort命令对BAM文件进行排序。例如,对名为input.bam的文件进行排序,可以使用以下命令:
```
samtools sort input.bam -o input.sorted.bam
```
这将生成一个名为input.sorted.bam的已排序的BAM文件。
2. 排序完成后,使用samtools index命令对排序的BAM文件进行索引。例如,对名为input.sorted.bam的文件进行索引,可以使用以下命令:
```
samtools index input.sorted.bam
```
这将生成一个名为input.sorted.bam.bai的bai索引文件,可以在IGV中使用。
注意,如果使用了CRAM格式的文件,则需要使用“.crai”文件作为索引文件的扩展名。