为了获得最佳的可移植性，ViennaRNA包使用GNU autoconf和automake工具，应该如何实现

为了在ViennaRNA软件包中使用GNU autoconf和automake工具，您需要按照以下步骤进行操作：

1. 编写configure.ac文件

首先，您需要编写一个configure.ac文件，该文件包含了ViennaRNA软件包的配置信息和依赖项。您可以使用autoconf宏来编写configure.ac文件，例如AC_INIT和AC_CONFIG_FILES等。在configure.ac文件中，还可以指定软件包的版本号、作者和许可证等信息。

2. 编写Makefile.am文件

接下来，您需要编写一个Makefile.am文件，该文件包含了ViennaRNA软件包的源代码、头文件和库文件等信息。您可以使用automake宏来编写Makefile.am文件，例如bin_PROGRAMS和lib_LTLIBRARIES等。在Makefile.am文件中，还可以指定软件包的编译选项和链接选项等信息。

3. 运行aclocal命令

在编写完configure.ac文件和Makefile.am文件后，您需要运行aclocal命令来生成aclocal.m4文件。该文件包含了autoconf宏和automake宏的定义，以便configure脚本和Makefile文件中使用。

aclocal

4. 运行autoconf命令

接下来，您需要运行autoconf命令来生成configure脚本。该脚本包含了ViennaRNA软件包的配置信息和依赖项，以便进行构建和安装。

autoconf

5. 运行automake命令

最后，您需要运行automake命令来生成Makefile文件。该文件包含了ViennaRNA软件包的源代码、头文件和库文件等信息，以便进行编译和链接操作。

automake --add-missing

完成上述步骤后，您就可以运行configure脚本进行构建和安装ViennaRNA软件包了。使用GNU autoconf和automake工具可以提高软件包的可移植性和可靠性，使其更易于在不同的计算机系统上使用和分发。