编写把csv数据集输入进GNN网络的代码

时间: 2024-03-27 22:38:57 浏览: 13
下面是一个简单的示例代码,用于将CSV数据集输入到图神经网络(GNN)中: ```python import pandas as pd import numpy as np import torch import torch.nn.functional as F from torch_geometric.data import Data # 读取CSV文件 df = pd.read_csv('data.csv') # 构建节点特征和边列表 x = torch.tensor(df.iloc[:, :-1].values, dtype=torch.float) edge_index = torch.tensor(df.iloc[:, -1:].values, dtype=torch.long).t().contiguous() # 构建数据对象 data = Data(x=x, edge_index=edge_index) # 定义GNN模型 class GNN(torch.nn.Module): def __init__(self): super(GNN, self).__init__() self.conv1 = torch.nn.Conv1d(1, 16, kernel_size=3) self.conv2 = torch.nn.Conv1d(16, 32, kernel_size=3) self.fc1 = torch.nn.Linear(32, 64) self.fc2 = torch.nn.Linear(64, 1) def forward(self, x, edge_index): x = F.relu(self.conv1(x.unsqueeze(1))) x = F.relu(self.conv2(x).squeeze()) x = F.relu(self.fc1(x)) x = self.fc2(x) return x # 实例化模型 model = GNN() # 输入数据到模型中进行训练或预测 output = model(data.x, data.edge_index) ``` 这段代码假设CSV文件的格式为:每行表示一个节点,前n-1列是节点的特征,最后一列是该节点连接的边的目标节点编号。在代码中,首先使用pandas库读取CSV文件,并将节点特征和边列表转换为PyTorch张量。然后,使用torch_geometric库中的Data类将节点特征和边列表组成一个数据对象。接下来,定义了一个简单的GNN模型,并将数据对象输入到模型中进行训练或预测。

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