使用PyTorch写一个图神经网络

时间: 2023-10-02 19:10:17 浏览: 108
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graph-neural-networks:在PyTorch中实现图神经网络的库

这里提供一个简单的图神经网络的PyTorch实现,用于节点分类任务。 首先,我们需要导入必要的库: ```python import torch import torch.nn as nn import torch.nn.functional as F from torch_geometric.datasets import Planetoid import torch_geometric.nn as pyg_nn import torch_geometric.transforms as T ``` 然后,我们需要加载数据集。这里使用了Planetoid数据集中的Cora数据集。 ```python dataset = Planetoid(root='/data', name='Cora', transform=T.NormalizeFeatures()) data = dataset[0] ``` 接下来,我们定义一个简单的图神经网络模型。这个模型包含一个GCN层和一个线性层。 ```python class Net(torch.nn.Module): def __init__(self): super(Net, self).__init__() self.conv1 = pyg_nn.GCNConv(dataset.num_node_features, 16) self.fc = torch.nn.Linear(16, dataset.num_classes) def forward(self, data): x, edge_index = data.x, data.edge_index x = self.conv1(x, edge_index) x = F.relu(x) x = F.dropout(x, training=self.training) x = self.fc(x) return F.log_softmax(x, dim=1) ``` 在forward函数中,我们首先将节点特征x和边信息edge_index传入GCN层中,得到GCN层的输出。然后,我们对输出进行ReLU激活和dropout操作,最后将其输入线性层进行分类。 接下来,我们定义训练函数和测试函数。 ```python def train(model, optimizer, data): model.train() optimizer.zero_grad() out = model(data) loss = F.nll_loss(out[data.train_mask], data.y[data.train_mask]) loss.backward() optimizer.step() return loss.item() def test(model, data): model.eval() out = model(data) pred = out.argmax(dim=1) acc = pred[data.test_mask].eq(data.y[data.test_mask]).sum().item() / data.test_mask.sum().item() return acc ``` 在训练函数中,我们首先将模型设为训练模式,然后使用优化器将梯度清零。接着,我们将数据传入模型中,得到输出并计算损失。最后,我们反向传播并更新模型参数。 在测试函数中,我们首先将模型设为测试模式,然后将数据传入模型中得到输出。接着,我们将输出转换为预测结果,并计算准确率。 最后,我们开始训练和测试模型。 ```python model = Net() optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=0.01, weight_decay=5e-4) for epoch in range(200): loss = train(model, optimizer, data) acc = test(model, data) print('Epoch {}, Loss: {:.4f}, Test Acc: {:.4f}'.format(epoch, loss, acc)) ``` 这里我们使用Adam优化器和交叉熵损失函数,进行200个epoch的训练。每个epoch结束后,我们输出当前的损失和测试准确率。 完整代码如下: ```python import torch import torch.nn as nn import torch.nn.functional as F from torch_geometric.datasets import Planetoid import torch_geometric.nn as pyg_nn import torch_geometric.transforms as T dataset = Planetoid(root='/data', name='Cora', transform=T.NormalizeFeatures()) data = dataset[0] class Net(torch.nn.Module): def __init__(self): super(Net, self).__init__() self.conv1 = pyg_nn.GCNConv(dataset.num_node_features, 16) self.fc = torch.nn.Linear(16, dataset.num_classes) def forward(self, data): x, edge_index = data.x, data.edge_index x = self.conv1(x, edge_index) x = F.relu(x) x = F.dropout(x, training=self.training) x = self.fc(x) return F.log_softmax(x, dim=1) def train(model, optimizer, data): model.train() optimizer.zero_grad() out = model(data) loss = F.nll_loss(out[data.train_mask], data.y[data.train_mask]) loss.backward() optimizer.step() return loss.item() def test(model, data): model.eval() out = model(data) pred = out.argmax(dim=1) acc = pred[data.test_mask].eq(data.y[data.test_mask]).sum().item() / data.test_mask.sum().item() return acc model = Net() optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=0.01, weight_decay=5e-4) for epoch in range(200): loss = train(model, optimizer, data) acc = test(model, data) print('Epoch {}, Loss: {:.4f}, Test Acc: {:.4f}'.format(epoch, loss, acc)) ```
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