python 生成mat数据最近邻距离图
时间: 2023-10-08 22:07:46 浏览: 112
要生成mat数据的最近邻距离图,可以使用Python中的scipy库。下面是一个简单的示例代码:
```python
import numpy as np
from scipy.spatial.distance import pdist, squareform
from scipy.sparse import csr_matrix
# 生成随机样本数据
X = np.random.rand(100, 10)
# 计算距离矩阵
distances = squareform(pdist(X))
# 将距离矩阵转换为稀疏矩阵
sparse_distances = csr_matrix(distances)
# 保存稀疏矩阵到mat文件中
import scipy.io
scipy.io.savemat('distances.mat', {'distances': sparse_distances})
```
这段代码中,首先生成了一个100x10的随机样本数据。然后使用`pdist`函数计算距离矩阵,并使用`squareform`函数将其转换为方阵。接着,使用`csr_matrix`函数将距离矩阵转换为稀疏矩阵。最后,使用`scipy.io.savemat`函数将稀疏矩阵保存到mat文件中。
相关问题
python mat文件的最近邻距离图
要读取mat文件中的稀疏矩阵,并生成最近邻距离图,可以使用Python中的scipy库。下面是一个简单的示例代码:
```python
import scipy.io
from scipy.sparse import find
import matplotlib.pyplot as plt
# 读取mat文件中的稀疏矩阵
data = scipy.io.loadmat('distances.mat')
distances = data['distances']
# 将稀疏矩阵转换为对称矩阵
distances = distances + distances.T - np.diag(distances.diagonal())
# 获取距离矩阵中非零元素的坐标和值
row, col, val = find(distances)
# 绘制最近邻距离图
plt.scatter(row, col, c=val, cmap='coolwarm')
plt.colorbar()
plt.show()
```
这段代码中,首先使用`scipy.io.loadmat`函数读取mat文件中的稀疏矩阵。然后,将稀疏矩阵转换为对称矩阵,以便绘制距离图。接着,使用`find`函数获取距离矩阵中非零元素的坐标和值。最后,使用`scatter`函数绘制最近邻距离图,并使用`colorbar`函数添加颜色条。
阅读全文
相关推荐
![-](https://img-home.csdnimg.cn/images/20241231044955.png)
![-](https://img-home.csdnimg.cn/images/20241231045053.png)
![-](https://img-home.csdnimg.cn/images/20241231045053.png)
![-](https://img-home.csdnimg.cn/images/20241231045053.png)
![-](https://img-home.csdnimg.cn/images/20241226111658.png)
![-](https://img-home.csdnimg.cn/images/20241226111658.png)
![-](https://img-home.csdnimg.cn/images/20241226111658.png)
![-](https://img-home.csdnimg.cn/images/20241226111658.png)
![-](https://img-home.csdnimg.cn/images/20241226111658.png)
![-](https://img-home.csdnimg.cn/images/20241226111658.png)
![-](https://img-home.csdnimg.cn/images/20241226111658.png)
![-](https://img-home.csdnimg.cn/images/20241226111658.png)
![-](https://img-home.csdnimg.cn/images/20241226111658.png)
![-](https://img-home.csdnimg.cn/images/20241226111658.png)
![-](https://img-home.csdnimg.cn/images/20241226111658.png)
![-](https://img-home.csdnimg.cn/images/20241226111658.png)
![-](https://img-home.csdnimg.cn/images/20241226111658.png)