用R下载TCGA乳腺癌表达值文件
时间: 2024-06-12 18:08:15 浏览: 207
TCGA简易下载工具
以下是用R下载TCGA乳腺癌表达值文件的步骤:
1. 安装TCGAbiolinks包:
```
install.packages("TCGAbiolinks")
```
2. 加载TCGAbiolinks包:
```
library(TCGAbiolinks)
```
3. 设置下载目录:
```
setwd("下载目录路径")
```
4. 下载TCGA乳腺癌表达值数据:
```
query <- GDCquery(project = "TCGA-BRCA",
data.category = "Transcriptome Profiling",
data.type = "Gene Expression Quantification",
platform = "Illumina HiSeq",
file.type = "normalized_results")
GDCdownload(query)
```
这将下载TCGA乳腺癌的基因表达数据,并保存在设置的下载目录中。
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