这个脚本有错误吗#!/bin/bash #JSUB -J MD-pingtai #JSUB -n 8 #JSUB -m gpu06 #JSUB -q gpu #JSUB -gpgpu 1 #JSUB -o output.%J #JSUB -e err.%J #############################################集群调取CPU信息####################################### source /hpcfile/jhinno/unischeduler/conf/jobstarter/unisched source /hpcfile/jhinno/unischeduler/conf/profile.unischeduler ##如果使用mpi进行集群需要在mpirun命令之使用下面两个变量############################################ # $JH_NCPU: 8 # $JH_HOSTFILE: list of computer hostfiles ################################################################################################### #######加载需要的软件环境(如果使用cuda,则必须指定运行在gpu队列)################################# module load cuda/11.0 module load intel/2016 #module load fftw333 module load openmpi/3.0.2 module load python/3.6.6/3.6.6 source /share/software/intel/compilers_and_libraries_2016.2.181/linux/mkl/bin/mklvars.sh intel64 #source /hpcfile/users/92023008/fftw_env.sh #################加载执行程序amber################################################################# export AMBERHOME=/hpcfile/software/amber22 test -f /hpcfile/software/amber22/amber.sh && source /hpcfile/software/amber22/amber.sh export CUDA_HOME=/hpcfile/software/cuda/cuda-11.0 export PATH=$PATH:$CUDA_HOME/bin export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$CUDA_HOME/lib64 python 1.py
时间: 2023-07-01 14:20:06 浏览: 271
这个脚本没有明显的语法错误,但是存在一些问题:
1. 该脚本中的注释符号应该使用“#”,而不是“#######”。
2. 脚本中的模块加载顺序可能存在问题,应该先加载mpi和cuda等计算资源相关的模块,再加载需要的软件环境。
3. 在加载软件环境时,应该使用对应软件的环境变量名,如“AMBERHOME”,而不是“$AMBER_HOME”。
4. 在加载Intel MKL库时,应该指定相应的架构类型,如“intel64”。
5. 在设置CUDA_HOME和LD_LIBRARY_PATH时,应该使用“=”符号而不是“$”符号。
改进后的脚本如下:
```
#!/bin/bash
#JSUB -J MD-pingtai
#JSUB -n 8
#JSUB -m gpu06
#JSUB -q gpu
#JSUB -gpgpu 1
#JSUB -o output.%J
#JSUB -e err.%J
#############################################集群调取CPU信息#######################################
source /hpcfile/jhinno/unischeduler/conf/jobstarter/unisched
source /hpcfile/jhinno/unischeduler/conf/profile.unischeduler
#########################################加载计算资源相关的模块###################################
module load cuda/11.0
module load openmpi/3.0.2
####################加载需要的软件环境(注意环境变量的名称)###################################
export AMBERHOME=/hpcfile/software/amber22
test -f /hpcfile/software/amber22/amber.sh && source /hpcfile/software/amber22/amber.sh
module load intel/2016
source /share/software/intel/compilers_and_libraries_2016.2.181/linux/mkl/bin/mklvars.sh intel64
module load python/3.6.6/3.6.6
export CUDA_HOME=/hpcfile/software/cuda/cuda-11.0
export PATH=$CUDA_HOME/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=$CUDA_HOME/lib64:$LD_LIBRARY_PATH
#############################################执行Python脚本#######################################
python 1.py
```
注:该脚本仅供参考,具体的软件环境、模块加载顺序等可能需要根据实际情况进行调整。
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