ViennaRNA必须安装在user/local/bin下吗
时间: 2023-12-02 22:02:52 浏览: 23
不一定,ViennaRNA并不一定需要安装在`/usr/local/bin`目录下。这主要取决于您的具体使用情况和安装需求。
如果您只是想在自己的账户下使用ViennaRNA,您可以将其安装在您的用户主目录下的任何目录中,比如`~/bin`目录。在这种情况下,您需要将该目录添加到您的`PATH`环境变量中,以便系统能够找到ViennaRNA可执行文件的位置。
如果您想将ViennaRNA安装到系统级别的位置,比如`/usr/local/bin`目录下,则需要使用root权限运行安装命令。在这种情况下,您需要确保系统中已经安装了所需的依赖项,并且您的用户账户具有安装软件所需的权限。
总之,ViennaRNA可以安装在任何您具有足够权限的目录下,具体取决于您的使用需求。
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如何让anaconda/envs/Viennarna中Viennarna在anaconda/bin/python3.8可以用
要让anaconda/envs/Viennarna中的ViennaRNA包在anaconda/bin/python3.8中可用,需要完成以下步骤:
1. 打开终端并激活Viennarna环境:
```
conda activate Viennarna
```
2. 确认ViennaRNA包已经安装成功:
```
RNAfold -h
```
如果成功安装,会显示RNAfold的帮助文档。
3. 找到anaconda/bin/python3.8的路径:
```
which python3.8
```
这个命令会显示anaconda/bin/python3.8的路径,例如:
```
~/anaconda3/bin/python3.8
```
4. 在anaconda/bin/python3.8的路径下创建一个软链接,指向Viennarna环境中的ViennaRNA包:
```
ln -s ~/anaconda3/envs/Viennarna/lib/python3.8/site-packages/viennarna ~/anaconda3/bin/
```
这个命令会在anaconda/bin/python3.8的路径下创建一个名为viennarna的软链接,指向Viennarna环境中的ViennaRNA包。
5. 确认viennarna软链接已经创建成功:
```
ls -l ~/anaconda3/bin/viennarna
```
如果成功创建,会显示类似于以下的信息:
```
lrwxr-xr-x 1 username staff 62 Apr 7 10:22 /Users/username/anaconda3/bin/viennarna -> /Users/username/anaconda3/envs/Viennarna/lib/python3.8/site-packages/viennarna
```
6. 现在,您可以在anaconda/bin/python3.8中导入ViennaRNA包:
```
import RNA
```
希望这些步骤可以帮助您在anaconda/bin/python3.8中成功导入ViennaRNA包。
如何让anaconda/envs/Viennarna中Viennarna在anaconda/lib/python3.8可以用
要让anaconda/envs/Viennarna中的ViennaRNA包在anaconda/lib/python3.8中可用,需要完成以下步骤:
1. 打开终端并激活Viennarna环境:
```
conda activate Viennarna
```
2. 确认ViennaRNA包已经安装成功:
```
RNAfold -h
```
如果成功安装,会显示RNAfold的帮助文档。
3. 找到anaconda/lib/python3.8/site-packages的路径:
```
python -c "import site; print(site.getsitepackages())"
```
这个命令会显示Python的site-packages路径,例如:
```
['/Users/username/anaconda3/lib/python3.8/site-packages', ...]
```
4. 在anaconda/lib/python3.8/site-packages的路径下创建一个软链接,指向Viennarna环境中的ViennaRNA包:
```
ln -s ~/anaconda3/envs/Viennarna/lib/python3.8/site-packages/viennarna ~/anaconda3/lib/python3.8/site-packages/
```
这个命令会在anaconda/lib/python3.8/site-packages的路径下创建一个名为viennarna的软链接,指向Viennarna环境中的ViennaRNA包。
5. 确认viennarna软链接已经创建成功:
```
ls -l ~/anaconda3/lib/python3.8/site-packages/viennarna
```
如果成功创建,会显示类似于以下的信息:
```
lrwxr-xr-x 1 username staff 62 Apr 7 10:22 /Users/username/anaconda3/lib/python3.8/site-packages/viennarna -> /Users/username/anaconda3/envs/Viennarna/lib/python3.8/site-packages/viennarna
```
6. 现在,您可以在anaconda/lib/python3.8中导入ViennaRNA包:
```
import RNA
```
希望这些步骤可以帮助您在anaconda/lib/python3.8中成功导入ViennaRNA包。