linux安装hmmer
时间: 2023-07-12 16:00:36 浏览: 173
你可以按照以下步骤在Linux系统上安装hmmer:
1. 打开终端,输入以下命令下载hmmer安装包:
```
wget http://eddylab.org/software/hmmer/hmmer-3.3.tar.gz
```
2. 解压安装包:
```
tar xvfz hmmer-3.3.tar.gz
```
3. 进入解压后的目录:
```
cd hmmer-3.3
```
4. 编译并安装hmmer:
```
./configure
make
sudo make install
```
5. 安装完成后,可以运行以下命令测试hmmer是否安装成功:
```
hmmbuild -h
hmmpress -h
hmmsearch -h
```
如果输出了相关帮助信息,则说明hmmer已经成功安装。
相关问题
ubuntu安装HMMER
要在Ubuntu上安装HMMER,可以按照以下步骤进行操作:
1. 首先,确保你的Ubuntu系统已经安装了gcc和g++编译器。你可以使用以下命令来安装它们:
```
sudo apt-get install build-essential
```
2. 然后,从HMMER官方网站下载最新的HMMER源代码包。你可以使用以下命令下载:
```
wget http://eddylab.org/software/hmmer/hmmer.tar.gz
```
3. 解压缩下载的源代码包。你可以使用以下命令进行解压缩:
```
tar -xzvf hmmer.tar.gz
```
4. 进入解压后的HMMER目录。你可以使用以下命令进入目录:
```
cd hmmer
```
5. 对HMMER进行配置和编译。你可以使用以下命令进行配置和编译:
```
./configure
make
```
6. 安装HMMER。你可以使用以下命令进行安装:
```
sudo make install
```
7. 安装完成后,你可以使用以下命令来验证HMMER是否成功安装:
```
hmmscan --version
```
这样,你就成功在Ubuntu上安装了HMMER。请注意,这些步骤假设你已经安装了必要的依赖库和软件,如GCC、G++和相关的开发包。如果你遇到任何问题,请参考HMMER的官方文档或寻求进一步的帮助。<span class="em">1</span><span class="em">2</span><span class="em">3</span>
#### 引用[.reference_title]
- *1* *2* [Ubuntu16.04安装后一些软件安装和环境配置](https://blog.csdn.net/zz683693/article/details/79192793)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_2"}}] [.reference_item style="max-width: 50%"]
- *3* [gem5运行SPECCPU2006benchmark](https://blog.csdn.net/qq_38877888/article/details/108759538)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_2"}}] [.reference_item style="max-width: 50%"]
[ .reference_list ]
安装hmmer3.3.2时 少了binaries
你好!对于安装 HMMER 3.3.2 时缺少二进制文件的问题,你可以尝试以下解决方法:
1. 检查是否正确下载了 HMMER 3.3.2 的完整压缩包。确保你从官方网站或可信的软件源下载了正确的文件。
2. 解压缩下载的压缩包,查看是否存在名为 "binaries" 的文件夹。如果没有该文件夹,可能是下载的文件不完整或者存在其他问题。
3. 如果你确定下载的文件完整而仍然缺少 binaries 文件夹,可以尝试从其他来源重新下载 HMMER 3.3.2。确保选择可信任的来源进行下载。
4. 如果你仍然无法找到 binaries 文件夹,你可以尝试在 HMMER 的官方论坛或社区中寻求帮助。其他用户可能会提供更多关于该问题的解决方案或提供缺失的文件。
希望这些信息能够帮助到你!如果你有任何其他问题,请随时提问。