r语言层次聚类
时间: 2023-07-18 21:05:15 浏览: 99
聚类_r语言聚类_
R语言中,层次聚类可以使用`hclust()`函数进行实现。该函数可以接受一个距离矩阵作为输入,并返回一个聚类树对象。
以下是一个示例代码:
```r
# 创建一个数据集
set.seed(123)
data <- matrix(rnorm(50), ncol=5)
# 计算欧几里得距离
dist_mat <- dist(data)
# 进行层次聚类
hc <- hclust(dist_mat)
# 绘制聚类树
plot(hc)
```
在这个例子中,我们首先创建了一个5维的数据集,然后使用`dist()`函数计算了欧几里得距离矩阵。接着,我们使用`hclust()`函数对距离矩阵进行层次聚类,并将结果保存在`hc`对象中。最后,我们使用`plot()`函数将聚类树进行可视化。
需要注意的是,`hclust()`函数还可以接受一个参数`method`,用于指定聚类算法的方法。默认情况下,该函数使用“complete linkage”方法进行聚类。如果需要使用其他聚类方法,可以将该参数设置为相应的值,例如:
```r
# 使用single linkage方法
hc <- hclust(dist_mat, method="single")
# 使用average linkage方法
hc <- hclust(dist_mat, method="average")
```
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