编写python脚本，读取两个以上fasta格式的序列文件，并输出无回车和空行的fasta文件

当你需要编写Python脚本来处理多个FASTA格式的序列文件，并去除输出文件中的回车和空行，你可以参考以下步骤和示例代码：

首先，你需要安装`biopython`库，它提供了一个方便的接口来解析和操作FASTA格式的数据。如果没有安装，可以使用下面的命令安装：

pip install biopython

然后，可以创建一个Python脚本，如下所示：

from Bio import SeqIO

def read_fasta_files(input_files):
    all_records = []
    for file in input_files:
        with open(file, 'r') as handle:
            records = list(SeqIO.parse(handle, "fasta"))
            all_records.extend(records)
    return all_records

def write_clean_fasta(output_file, records):
    with open(output_file, 'w') as handle:
        for record in records:
            sequence = str(record.seq).replace('\n', '')
            handle.write(f">{record.id}\n{sequence}\n")

# 例子：
input_files = ['file1.fasta', 'file2.fasta']  # 替换为你的文件路径
output_file = 'combined.fasta'  # 输出合并后的文件名

records = read_fasta_files(input_files)
write_clean_fasta(output_file, records)