[Errno 22] Invalid argument: '\x01\reaction_0.png'
时间: 2023-11-19 07:45:12 浏览: 150
出现"[Errno 22] Invalid argument: '\x01\reaction_0.png'"的错误是因为文件路径中包含了无效的字符。在Windows系统中,反斜杠(\)被用作路径分隔符,但在字符串中表示特殊字符的转义字符。因此,\r 被解释为回车符(carriage return),\n 被解释为换行符(newline)。
为了解决这个问题,您可以使用原始字符串(raw string)来表示文件路径,或者使用正斜杠(/)作为路径分隔符。以下是一个修正后的示例代码:
```python
import pandas as pd
from rdkit import Chem
from rdkit.Chem import Draw
from rdkit.Chem import AllChem
# 读取数据文件
data = pd.read_csv('input.csv')
# 获取rxn_smiles列的数据
rxn_smiles = data['rxn_smiles']
# 遍历每个 rxn_smiles 字符串并保存图片
for i, smi in enumerate(rxn_smiles):
print(smi)
rxn = Chem.AllChem.ReactionFromSmarts(smi)
if rxn is not None:
# 绘制反应结构
img = Draw.ReactionToImage(rxn)
img.show()
img.save(fr'reaction_{i}.png')
else:
print("Failed to parse rxn_smiles:", smi)
```
在上述代码中,我们使用原始字符串(raw string)前缀(`r`)来表示文件路径,确保转义字符不会被解释。另外,我们使用正斜杠(`/`)作为路径分隔符,以避免与转义字符冲突。
请注意,在运行代码之前,请确保文件路径有效,并且您有写入文件的权限。
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