devtools::install_github("Moonerss/CIBERSORT") Skipping install of 'CIBERSORT' from a github remote, the SHA1 (cf2b173f) has not changed since last install. Use `force = TRUE` to force installation

这是因为你在之前已经安装了 `CIBERSORT` 包，而且该包的代码没有更新，所以它不需要重新安装。如果你想更新已安装的包，请使用 `force = TRUE` 参数来强制重新安装。例如：

devtools::install_github("Moonerss/CIBERSORT", force = TRUE)

这将会强制重新安装 `CIBERSORT` 包，并覆盖旧版本。

相关问题

if(!file.exists(f)){ #devtools:: install_github ("Moonerss/CIBERSORT") library(CIBERSORT) lm22f = system.file("extdata", "LM22.txt", package = "CIBERSORT") TME.results = cibersort(lm22f, "exp.txt" , perm = 1000, QN = T) save(TME.results,file = f) } load(f) TME.results[1:4,1:4]

根据您提供的代码片段，这是一段 R 代码。该代码的作用是检查一个名为 `f` 的文件是否存在，如果不存在，则从 GitHub 上安装 `CIBERSORT` 包并加载它，然后使用 `cibersort()` 函数对数据进行 CIBERSORT 分析，并将结果存储到文件 `f` 中。如果文件 `f` 存在，则直接加载其中的结果并输出前 4 行和前 4 列。

具体而言，该代码使用 `system.file()` 函数获取 `LM22.txt` 文件的路径，并将其与名为 `exp.txt` 的表达数据一起传递给 `cibersort()` 函数，使用 `perm = 1000` 参数设置重排次数为 1000，使用 `QN = T` 参数执行表达数据的量化归一化。

最后，代码使用 `save()` 函数将结果保存到文件中，并使用 `load()` 函数加载文件中的结果，再使用索引选取前 4 行和前 4 列的子集并输出。