筛选与预后相关的基因

根据引用\[1\]中的描述，您可以通过COX单因素分析来筛选与预后相关的基因。具体步骤如下：

1. 首先，您需要准备好TCGA的整个基因集的数据。这可能是一个复杂而繁琐的过程，需要耐心和对数据的深入理解。

2. 在数据准备阶段，您可以使用代码来过滤和标准化数据。您可以使用limma和edgeR等R包来进行这些操作。具体的代码可以参考引用\[3\]中的示例。

3. 在数据准备完成后，您可以进行COX单因素分析。这将帮助您确定与预后相关的基因。您可以使用R中的survival包来进行COX分析。

4. 在COX分析中，您可以计算每个基因的基本参数和统计量。这将帮助您评估每个基因与预后的相关性。

通过以上步骤，您可以筛选出与预后相关的基因，并获得这些基因的基本参数、统计量等信息。这些基因可以被复集到您的目标基因集中，以进一步研究其功能和富集情况。
#### 引用[.reference_title]
- *1* *2* *3* [泛癌分析·找出各个癌症的预后相关基因](https://blog.csdn.net/weixin_43250801/article/details/124232608)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^koosearch_v1,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item]
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