Pubmed-Batch-Download怎么用
时间: 2024-09-21 14:01:47 浏览: 64
PubMed-Batch-Download是一个用于批量下载PubMed数据库中的文献信息的Python库。它简化了从PubMed API获取文献元数据的过程,允许用户输入关键词、作者名、发表日期等条件,然后生成CSV或其他格式的文件,包含了搜索结果的相关信息。
以下是使用PubMed-Batch-Download的基本步骤:
1. 安装库:首先需要安装这个库,可以使用pip命令:
```
pip install pubmed_batch_download
```
2. 导入库并初始化:导入`pubmed_batch_download`模块,并创建一个下载器实例:
```python
from pubmed_batch_download import PubMedDownloader
downloader = PubMedDownloader()
```
3. 设置搜索参数:根据需求设置查询词、作者、出版年份等过滤条件:
```python
query = "your_search_term" # 替换为实际搜索的关键词
start_date = "2020" # 搜索起始年份
end_date = "2022" # 搜索结束年份
```
4. 下载数据:调用`download()`方法,传入搜索参数,保存到指定文件路径:
```python
results = downloader.download(query=query, start_date=start_date, end_date=end_date)
results.to_csv("output.csv") # 将结果保存为CSV文件
```
5. (可选) 分页下载:如果API返回的数据量大,你可以分页下载:
```python
pages = downloader.iter_download_pages(query, start_date, end_date)
```
请注意,PubMed-Batch-Download可能会受到PubMed API的速率限制,所以使用时需要遵守服务条款。
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