luna16数据集转换为png格式
时间: 2024-05-15 10:12:25 浏览: 228
LUNA16数据集是一个医学影像数据集,包含了用于肺癌检测的CT扫描影像。要将LUNA16数据集转换为PNG格式,可以按照以下步骤进行:
1. 下载LUNA16数据集,包含了DICOM格式的CT扫描图像和CSV文件。
2. 安装Python的pydicom库,用于读取DICOM图像。
3. 编写Python脚本,读取DICOM图像并将其转换为PNG格式。以下是一个示例脚本:
``` python
import os
import numpy as np
import pydicom
from PIL import Image
# 设置数据集路径和输出路径
data_path = "path/to/LUNA16/data/"
output_path = "path/to/output/folder/"
# 读取CSV文件,获取需要转换的图像ID列表
with open(os.path.join(data_path, "annotations.csv"), "r") as f:
lines = f.readlines()
ids = [line.split(",")[0] for line in lines[1:]]
# 逐个读取DICOM图像并转换为PNG格式
for id in ids:
# 读取DICOM图像
filename = os.path.join(data_path, "subset1", id + ".mhd")
ds = pydicom.dcmread(filename)
# 将DICOM图像转换为numpy数组
img = ds.pixel_array
# 将CT值归一化到0-255范围
img = (img - np.min(img)) / (np.max(img) - np.min(img)) * 255
img = img.astype(np.uint8)
# 将numpy数组转换为PIL图像
pil_img = Image.fromarray(img)
# 保存为PNG格式
output_filename = os.path.join(output_path, id + ".png")
pil_img.save(output_filename)
```
4. 运行脚本,等待转换完成。
需要注意的是,LUNA16数据集非常大,包含数千个图像文件,转换过程可能比较耗时。建议使用GPU加速和多线程处理来提高转换速度。
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