data = np.loadtxt(raw_data , delimiter = ',')
时间: 2024-04-10 15:30:58 浏览: 115
这是一个加载数据的常见方法,使用了NumPy库中的`loadtxt`函数。`loadtxt`函数用于从文件中加载数据,并将其存储为NumPy数组。在这个例子中,函数的参数`raw_data`是文件的路径,`delimiter`参数指定了数据的分隔符(这里是逗号)。
调用`np.loadtxt(raw_data, delimiter=',')`会将文件中的数据按照逗号进行分割,并将结果存储在名为`data`的NumPy数组中。
相关问题
filename = '乳腺癌数据集' with open(filename , 'rt') as raw_data: data = np.loadtxt(raw_data , delimiter = ',') print(data.shape)
这段代码打开了名为 '乳腺癌数据集' 的文件,并使用 `with open` 语句将其作为文本文件打开。然后,它使用 `np.loadtxt` 函数将文件中的数据加载到 NumPy 数组中,分隔符仍然是逗号。加载后的数据存储在名为 `data` 的 NumPy 数组中。最后,使用 `print(data.shape)` 打印了 `data` 数组的形状。
请注意,这里使用的文件名 '乳腺癌数据集' 可能是示例中的一个虚拟文件名,具体文件名应根据实际情况进行更改。
帮我写个Python程序,要求如下: 1.从采集到的PPG信号文件中导入数据,2.采样频率为40Hz。3.计算所采集到的全部数据的持续时间并告知用户,然后用户可以任意指定某个时间段进行心率分析。4.用户输入分析时间段为x1分y1秒到x2分y2秒,则开始分析位置为(x1*60+y1)40*6,分析数据点数量为((x2-x1)*60+(y2-y1))*40,注意保证程序健壮性,要对用户输入的分析时间是否合理进行判断)。分析该时间段内所有完整心跳周期的平均心率并打印出来,单位为次/分,精确到小数点后1位。 2) 绘制出所分析数据的图形,包括原始波形和进行均值滤波之后的波形,作为两个子图放在同一figure中;在进行均值滤波之后的波形图中找出所分析时间段内全部PPG信号的完整周期,即在波峰或波谷处用明显的标识标出
好的,以下是程序的代码实现:
```python
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
# 读取PPG信号文件数据
def read_data(file_path):
data = np.loadtxt(file_path, delimiter=',')
return data
# 计算数据持续时间
def get_duration(data, fs):
duration = len(data) / fs
return duration
# 计算心率
def get_heart_rate(data, fs, start_time, end_time):
start_index = int(start_time * fs * 60)
end_index = int(end_time * fs * 60)
if end_index > len(data):
end_index = len(data)
if start_index >= end_index:
return "分析时间不合理,请重新输入"
analyze_data = data[start_index:end_index]
# 均值滤波
filtered_data = np.convolve(analyze_data, np.ones(8)/8, mode='same')
# 寻找波峰和波谷位置
peak_index = []
valley_index = []
for i in range(1, len(filtered_data)-1):
if filtered_data[i] > filtered_data[i-1] and filtered_data[i] > filtered_data[i+1]:
peak_index.append(i)
elif filtered_data[i] < filtered_data[i-1] and filtered_data[i] < filtered_data[i+1]:
valley_index.append(i)
if len(peak_index) <= 1 or len(valley_index) <= 1:
return "分析时间段内未找到完整心跳周期"
heart_beat_count = min(len(peak_index), len(valley_index))
time_span = (end_index - start_index) / fs / 60
heart_rate = heart_beat_count / time_span
return round(heart_rate, 1)
# 绘制图形
def plot_data(data, fs, start_time, end_time):
start_index = int(start_time * fs * 60)
end_index = int(end_time * fs * 60)
if end_index > len(data):
end_index = len(data)
if start_index >= end_index:
return "分析时间不合理,请重新输入"
analyze_data = data[start_index:end_index]
# 均值滤波
filtered_data = np.convolve(analyze_data, np.ones(8)/8, mode='same')
# 寻找波峰和波谷位置
peak_index = []
valley_index = []
for i in range(1, len(filtered_data)-1):
if filtered_data[i] > filtered_data[i-1] and filtered_data[i] > filtered_data[i+1]:
peak_index.append(i)
elif filtered_data[i] < filtered_data[i-1] and filtered_data[i] < filtered_data[i+1]:
valley_index.append(i)
# 绘制原始波形和滤波后的波形
plt.figure(figsize=(10, 8))
plt.subplot(211)
plt.plot(data[start_index:end_index])
plt.title("Raw PPG Signal")
plt.xlabel("Time (s)")
plt.ylabel("Amplitude")
plt.subplot(212)
plt.plot(filtered_data)
plt.title("Filtered PPG Signal")
plt.xlabel("Time (s)")
plt.ylabel("Amplitude")
# 标记波峰和波谷
for i in peak_index:
if i > 0 and i < len(filtered_data)-1:
if filtered_data[i] > filtered_data[i-1] and filtered_data[i] > filtered_data[i+1]:
plt.plot(i, filtered_data[i], marker='o', markersize=10, color="red")
for i in valley_index:
if i > 0 and i < len(filtered_data)-1:
if filtered_data[i] < filtered_data[i-1] and filtered_data[i] < filtered_data[i+1]:
plt.plot(i, filtered_data[i], marker='o', markersize=10, color="green")
plt.show()
# 主函数
if __name__ == '__main__':
file_path = "ppg_signal.csv"
fs = 40 # 采样频率为40Hz
data = read_data(file_path)
duration = get_duration(data, fs)
print("数据持续时间为:", round(duration, 2), "秒")
while True:
try:
start_time = float(input("请输入分析时间段的起始时间(单位:分):"))
start_sec = int(start_time * 60) % 60
start_min = int(start_time)
end_time = float(input("请输入分析时间段的结束时间(单位:分):"))
end_sec = int(end_time * 60) % 60
end_min = int(end_time)
break
except ValueError:
print("输入格式错误,请重新输入")
heart_rate = get_heart_rate(data, fs, start_time, end_time)
print("心率为:", heart_rate, "次/分")
plot_data(data, fs, start_time, end_time)
```
使用方法:
1. 将采集到的PPG信号文件命名为ppg_signal.csv,并放在程序运行的目录下。
2. 运行程序,按照提示输入分析时间段的起始时间和结束时间,单位为分钟。
3. 程序会计算出分析时间段内的心率,并展示原始波形和滤波后的波形,并标记出波峰和波谷位置。
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