用Perl语言编写程序,在DNA 片段: “CCACCGTGATATTACCCTGTTATAAAACCCGG GAAACTTTGGGCACCCTGAACT ”中 (a)寻找“ACCCTG”出现的位置(不用index函数
时间: 2023-10-06 07:10:09 浏览: 55
好的,我可以帮你编写Perl程序,寻找“ACCCTG”在给定DNA片段中出现的位置,以下是示例代码:
```
#!/usr/bin/perl
use strict;
use warnings;
my $dna = "CCACCGTGATATTACCCTGTTATAAAACCCGGGAAACTTTGGGCACCCTGAACT";
my $pattern = "ACCCTG";
my $pos = -1;
my $len = length($dna);
while (($pos = match($dna, $pattern, $pos+1)) < $len && $pos >= 0) {
print "Found at position: $pos\n";
}
sub match {
my ($text, $pattern, $start) = @_;
my $n = length($text);
my $m = length($pattern);
for (my $i = $start; $i <= $n-$m; $i++) {
my $j;
for ($j = 0; $j < $m; $j++) {
last if (substr($text, $i+$j, 1) ne substr($pattern, $j, 1));
}
return $i if ($j == $m);
}
return -1;
}
```
这段代码首先定义了一个DNA片段和要寻找的模式“ACCCTG”。然后,使用match函数在DNA片段中查找模式,并将出现位置打印出来。注意,这里没有使用Perl内置的index函数,而是自己编写了一个match函数来实现字符串匹配。