使用python实现DBSCAN算法,要求文件读入经纬坐标,输出聚类图像,调用python颜色库函数为类簇分类
时间: 2024-05-03 10:22:37 浏览: 226
以下是一个使用python实现DBSCAN算法的示例代码:
```python
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.cluster import DBSCAN
from sklearn import metrics
from sklearn.datasets import make_blobs
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
# 读入经纬度坐标数据
data = np.loadtxt('data.csv', delimiter=',', usecols=(0,1))
# 标准化数据
data = StandardScaler().fit_transform(data)
# 设置DBSCAN参数
db = DBSCAN(eps=0.3, min_samples=10).fit(data)
core_samples_mask = np.zeros_like(db.labels_, dtype=bool)
core_samples_mask[db.core_sample_indices_] = True
labels = db.labels_
# 获取聚类数
n_clusters_ = len(set(labels)) - (1 if -1 in labels else 0)
# 评估聚类结果
print('Estimated number of clusters: %d' % n_clusters_)
print("Silhouette Coefficient: %0.3f"
% metrics.silhouette_score(data, labels))
# 绘制聚类图像
unique_labels = set(labels)
colors = [plt.cm.Spectral(each)
for each in np.linspace(0, 1, len(unique_labels))]
for k, col in zip(unique_labels, colors):
if k == -1:
col = [0, 0, 0, 1]
class_member_mask = (labels == k)
xy = data[class_member_mask & core_samples_mask]
plt.plot(xy[:, 0], xy[:, 1], 'o', markerfacecolor=tuple(col),
markeredgecolor='k', markersize=14)
xy = data[class_member_mask & ~core_samples_mask]
plt.plot(xy[:, 0], xy[:, 1], 'o', markerfacecolor=tuple(col),
markeredgecolor='k', markersize=6)
plt.title('Estimated number of clusters: %d' % n_clusters_)
plt.show()
```
在上述代码中,我们首先读入经纬度坐标数据,并使用`StandardScaler`将其标准化。然后,我们设置DBSCAN算法的参数,包括`eps`和`min_samples`。接着,我们使用`fit`方法对数据进行聚类,并获取聚类结果的标签。最后,我们使用matplotlib库绘制聚类图像,并使用不同的颜色区分不同的聚类簇。
需要注意的是,在绘制聚类图像时,我们使用了python的颜色库函数`plt.cm.Spectral`,该函数可以为每个聚类簇分配一个不同的颜色。同时,我们还使用了`markersize`参数来调整聚类点的大小。
阅读全文