我的分组文件是：Group-DC.txt，以SurvivalBenefit列信息进行分组（Benefit和Non-Benefit），我想以Non-Benefit作为对照组可以吗？

当然可以。如果你想将以SurvivalBenefit列为“Non-Benefit”的群体作为对照组，你需要先修改`cluFile`变量，使其指向包含"Non-Benefit"这一类别的文件。接下来，在构建设计矩阵时，你应该指定`factor(Type)`为SurvivalBenefit列，其中非Benefit为参照组（通常是0或者"Non-Benefit"）。这将改变默认的比较方向，使得其他类别（比如Benefit）与Non-Benefit进行对比。

以下是相应部分的代码修改示例：

# 读取 cluster 文件，注意这里假设SurvivalBenefit列是名为'Benefit'或'Non-Benefit'
cluster = read.table("Group-DC.txt", header = TRUE, sep = "\t", check.names = FALSE, row.names = 1, stringsAsFactors = FALSE)

# 如果SurvivalBenefit列名是'Benefit'，则更改为'Non-Benefit'
if ("Benefit" %in% names(cluster)) {
  cluster$Non_Benefit = cluster$Benefit
  cluster$Benefit = NULL  # 移除Benefit列，因为我们不再需要它
}

# 重新设置分组变量
Type = as.vector(cluster$Non_Benefit)  # 将Non-Benefit设为对照组

然后，在创建设计矩阵时，你会看到`design`会反映出这种更改，即比较Benefit组与Non-Benefit组的差异。记得检查文件结构是否正确，并根据实际情况调整。