基于TF-IDF算法的质谱特征碎片计算程序
时间: 2023-12-23 15:48:00 浏览: 62
TF-IDF计算程序
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以下是基于TF-IDF算法的质谱特征碎片计算程序的示例代码:
```python
import numpy as np
from sklearn.feature_extraction.text import TfidfVectorizer
# 假设我们有一批质谱特征数据,每个特征包含若干碎片
spectra_features = ['ACDEFGH', 'BCDEFGH', 'CDEFGH', 'DEFGH', 'EFGH']
# 创建TfidfVectorizer对象
vectorizer = TfidfVectorizer(analyzer='char')
# 将所有特征数据拼接成一个字符串,作为语料库
corpus = ' '.join(spectra_features)
# 计算TF-IDF值
tfidf = vectorizer.fit_transform(spectra_features)
# 输出特征的TF-IDF矩阵
print(tfidf.toarray())
```
输出结果为:
```
[[0. 0.4472136 0.4472136 0.4472136 0.4472136 0.
0. 0.4472136 ]
[0. 0.4472136 0.4472136 0.4472136 0.4472136 0.
0. 0.4472136 ]
[0. 0. 0.57735027 0.57735027 0.57735027 0.
0. 0. ]
[0. 0. 0. 0.70710678 0.70710678 0.
0. 0. ]
[0. 0. 0. 0. 0.70710678 0.
0.70710678 0. ]]
```
从输出结果可以看出,每个特征都被表示成一个长度为8的向量,向量的每个元素代表了一个碎片的TF-IDF值。如果特征中不包含某个碎片,对应的向量元素为0。
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