UserWarning: Clustering large matrix with scipy. Installing `fastcluster` may give better performance. warnings.warn(msg)
时间: 2024-03-21 18:43:00 浏览: 231
1238: UserWarning: findfont: Font family [‘sans-serif’] not found. Falling back to DejaVu Sans.
这个警告信息是由于使用 `scipy` 库进行聚类时,输入的数据矩阵较大,计算时间可能较长。提示建议安装 `fastcluster` 库以提高聚类性能。
`fastcluster` 是一个 C++ 实现的快速聚类算法库,它的聚类速度比 `scipy` 库中的实现要快很多。你可以通过以下命令来安装 `fastcluster` 库:
```python
!pip install fastcluster
```
然后在代码中导入 `fastcluster` 库,使用 `linkage` 函数进行聚类即可,示例代码如下:
```python
from fastcluster import linkage
from scipy.spatial.distance import pdist
# 计算距离矩阵
dist_matrix = pdist(data)
# 使用 fastcluster 进行聚类
clusters = linkage(dist_matrix, method='ward')
```
这样就可以使用 `fastcluster` 库进行快速聚类了。
阅读全文