matlab cryo-EM

MATLAB在cryo-EM中使用广泛。通过MATLAB，可以预处理数据并提取方向和相关参数。一个例子是使用MATLAB函数（getStarFile.m）从.star文件中提取数据。此外，还可以使用MATLAB代码库来绘制3D重建的欧拉角分布。通过使用UCSF Chimera打开.bild文件，可以可视化欧拉角。此外，您还可以使用MATLAB生成一维直方图来分析欧拉角数据。此外，MATLAB还提供了函数（如SolventAndProteinDensity()）来模拟蛋白质的3D电子散射密度，其中自动包含周围水（冰）的连续模型，使模拟更加逼真。