showDatabaseCategory(CellChatDB) #作 者提供了可视化的代码,可以看到该数据库中“Secreted Signaling”占比过半 Error in grDevices::pdf(NULL, width = width, height = height) : Graphics API version mismatch 什么问题
时间: 2024-04-20 12:27:43 浏览: 14
这个错误可能是由于您使用的R版本与绘图设备(grDevices)包中使用的图形API版本不兼容导致的。您可以尝试以下解决方法:
1. 确保您的R版本和绘图设备包(grDevices)是最新的。可以尝试更新R版本和相应的包,然后再次运行代码。
2. 如果您已经使用最新版本的R和绘图设备包,但仍然遇到此错误,请尝试重新安装绘图设备包。可以使用以下命令从CRAN重新安装grDevices包:
```R
install.packages("grDevices")
```
3. 如果以上方法仍然无效,您可以尝试使用其他绘图设备或图形输出格式来保存图像,例如使用png()函数来保存为PNG格式:
```R
png("plot.png", width = 800, height = 600)
showDatabaseCategory(CellChatDB)
dev.off()
```
希望这些解决方法能够帮助您解决问题。如果问题仍然存在,请提供更多的错误信息和上下文,以便我们能够更好地帮助您。