Ubuntu 源代码安装bwa

Ubuntu源代码安装BWA（Burrows-Wheeler Aligner）意味着从原始的代码库下载源码，然后通过编译器自动生成可执行文件。以下是基本步骤：

1. **更新源列表**：首先更新你的Ubuntu源代码列表，确保获取到最新的软件包信息。

   sudo apt-get update

2. **安装必要的构建工具**：因为BWA是C++编写，所以需要`gcc`, `g++`, 和 `make`等编译工具。

   sudo apt-get install build-essential libbz2-dev zlib1g-dev

3. **下载BWA源码**：访问BWA的官方网站（https://github.com/lh3/bwa）或者GitHub克隆仓库。

   git clone https://github.com/lh3/bwa.git
   cd bwa

4. **编译源码**：进入项目目录后，切换至适当的分支（如master），然后运行`make`（如果`configure`文件存在，则先运行`./configure`）。

   ./configure
   make

5. **安装**：如果没有错误，你可以使用`sudo make install`来安装BWA到系统的全局路径。

   sudo make install

6. **检查安装**：安装完成后，你可以通过`which bwa`来验证BWA是否已成功安装到`$PATH`中。

注意，如果遇到错误，查看BWA的官方文档或者GitHub issue可能会有所帮助。