MATLAB中如何可视化PLS-DA的结果?
时间: 2024-10-17 07:03:33 浏览: 48
matlab中存档算法代码-pls-da:适用于MATLAB的硬PLS-DA和软PLS-DA的实现
在MATLAB中,Partial Least Squares Discriminant Analysis (PLS-DA)是一种用于高维数据分类和特征提取的统计方法。PLS-DA结合了主成分分析(PCA)和判别分析(DA),常用于生物医学、化学等领域。可视化PLS-DA结果通常涉及以下几个步骤:
1. **加载数据**:
使用`loaddata`函数导入包含样本和变量的数据集。
2. **进行PLS-DA**:
使用`plsdac`函数执行PLS-DA,并获取得分矩阵(反映各样品在PLS方向上的投影)和权重矩阵(表示变量对类别影响的贡献)。
```matlab
[score, weight, pred] = plsdac(X, Y);
```
其中`X`是样本数据矩阵,`Y`是类别标签向量。
3. **绘制得分图**:
可以通过`plotScree(score)`或`plot(score, 'type', 'scatter')`来查看PLS模式的贡献程度,以及样本之间的分散情况。
4. **分类边界**:
`plotWeightedScore(score, weight, Y)`可以画出二维得分图上不同类别的决策边界。
5. **模型评估**:
检查混淆矩阵(confusionmat(pred, Y)`),并可能绘制混淆矩阵图形。
6. **变量重要性**:
如果需要,还可以使用`bar(weight(:, :, :)`, 或者`imagesc(weight)`来展示变量在PLS-DA模型中的相对重要性。
阅读全文