(base) [maliuyin@mn01 cleandata]$ multiqc -o ./qc/ ./qc/*.zip bash: multiqc: command not found...

您遇到的问题是在终端中输入了命令后，系统提示"multiqc: command not found"。这通常意味着您尝试运行的`multiqc`命令在您的系统环境变量中没有被识别。可能的原因包括`multiqc`没有安装，或者安装的位置不在环境变量`PATH`中。为了使用`multiqc`，您需要确保已经正确安装了它，并且其可执行文件的路径需要被添加到`PATH`环境变量中。

解决这个问题的步骤大致如下：

1. 确认`multiqc`是否已经安装在您的系统中。如果尚未安装，您需要先安装它。`multiqc`是一个用于汇总生物信息学分析结果的工具，可以通过Python的包管理工具`pip`来安装。在终端中执行以下命令尝试安装`multiqc`：

   pip install multiqc

2. 安装完成后，您需要检查`multiqc`的安装位置。在Unix-like系统中，Python安装的可执行文件通常位于如下路径之一：

   /usr/local/bin/multiqc
   /usr/bin/multiqc

您可以通过以下命令查看`multiqc`的确切位置：

   which multiqc

或者

   type multiqc

3. 如果`which`或`type`命令返回了`multiqc`的安装路径，那么您需要将该路径添加到环境变量`PATH`中。可以通过编辑您的shell配置文件（如`.bashrc`或`.bash_profile`），在文件中添加以下行：

   export PATH=$PATH:/path/to/multiqc

替换`/path/to/multi古镇`为实际的`multiqc`路径。之后，您需要重新加载配置文件或重新打开终端窗口，这样改动才能生效。

4. 重新尝试运行命令，如果`PATH`设置正确，这次应该不会再出现"command not found"的错误。