lammps 原子连接

LAMMPS（Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator）是一种经典分子动力学软件，用于模拟原子、分子和其他粒子系统。在 LAMMPS 中，原子之间的连接可以通过原子间键、角和二面角等方式进行建模。

原子间键通常用于描述原子之间的共价连接，比如化学键。常见的键模型包括简单的弹簧模型、修正的弹簧模型（如 Morse 势）和弹性带模型等。

角描述了原子之间的角度关系，常用于描述分子中的非线性部分。常见的角模型包括简单的角势和二次多项式角势。

二面角用于描述分子中原子之间的扭转关系。常见的二面角模型包括周期性二面角势和多项式二面角势等。

在 LAMMPS 中，你可以通过定义原子类型和相应的键、角和二面角参数来设置原子之间的连接关系。这些参数可以通过力场文件或直接在输入脚本中指定。

需要注意的是，具体的原子连接模型取决于所使用的力场和系统的特性，因此在使用 LAMMPS 进行原子连接建模时，需要仔细选择适合你研究对象的力场和参数设置。