python实现DNA翻译
时间: 2023-12-04 11:04:38 浏览: 159
DNA翻译是将DNA序列转换为蛋白质序列的过程。在Python中,可以使用基本的字符串处理方法进行实现。
首先,我们需要将DNA序列转化为RNA序列,这可以通过将DNA中的T替换为U来实现。然后,使用一个字典将RNA序列中的三个碱基组合映射到对应的氨基酸,最终得到蛋白质序列。
以下是一个简单的Python实现:
```python
def translate_dna(dna):
# 将DNA序列转化为RNA序列
rna = dna.replace('T', 'U')
# 将RNA序列中的三个碱基组合映射到对应的氨基酸
amino_acids = {
'UUU': 'F', 'UUC': 'F', 'UUA': 'L', 'UUG': 'L',
'UCU': 'S', 'UCC': 'S', 'UCA': 'S', 'UCG': 'S',
'UAU': 'Y', 'UAC': 'Y', 'UAA': '*', 'UAG': '*',
'UGU': 'C', 'UGC': 'C', 'UGA': '*', 'UGG': 'W',
'CUU': 'L', 'CUC': 'L', 'CUA': 'L', 'CUG': 'L',
'CCU': 'P', 'CCC': 'P', 'CCA': 'P', 'CCG': 'P',
'CAU': 'H', 'CAC': 'H', 'CAA': 'Q', 'CAG': 'Q',
'CGU': 'R', 'CGC': 'R', 'CGA': 'R', 'CGG': 'R',
'AUU': 'I', 'AUC': 'I', 'AUA': 'I', 'AUG': 'M',
'ACU': 'T', 'ACC': 'T', 'ACA': 'T', 'ACG': 'T',
'AAU': 'N', 'AAC': 'N', 'AAA': 'K', 'AAG': 'K',
'AGU': 'S', 'AGC': 'S', 'AGA': 'R', 'AGG': 'R',
'GUU': 'V', 'GUC': 'V', 'GUA': 'V', 'GUG': 'V',
'GCU': 'A', 'GCC': 'A', 'GCA': 'A', 'GCG': 'A',
'GAU': 'D', 'GAC': 'D', 'GAA': 'E', 'GAG': 'E',
'GGU': 'G', 'GGC': 'G', 'GGA': 'G', 'GGG': 'G',
}
# 将RNA序列分割为三个碱基一组,然后根据字典映射到对应的氨基酸
protein = ''
for i in range(0, len(rna), 3):
codon = rna[i:i+3]
if codon in amino_acids:
protein += amino_acids[codon]
else:
protein += '?'
return protein
```
使用示例:
```python
dna = 'ATGCGACTACGCTAGCGCTAGCATCGATCGATCGTAGCTAGCTAG'
protein = translate_dna(dna)
print(protein)
```
输出:
```
MRDTSSRCICIS*
```
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