作为一个医学方向的资深python程序员,告诉我怎么用python的代码实现3x3列联表fisher精确检验

时间: 2024-02-06 08:08:50 浏览: 22
要实现3x3列联表Fisher精确检验,可以使用Python的SciPy库中的函数 `fisher_exact()`。以下是示例代码: ```python from scipy.stats import fisher_exact # 构建3x3列联表 obs = [[10, 5, 5], [5, 10, 5], [5, 5, 10]] # 进行Fisher精确检验 oddsratio, pvalue = fisher_exact(obs) print("Odds ratio:", oddsratio) print("p-value:", pvalue) ``` 在这个例子中,我们构建了一个3x3的列联表,然后使用 `fisher_exact()` 函数进行Fisher精确检验。函数将返回两个值,一个是odds ratio,另一个是p-value。我们将这两个值打印出来以便查看。 注意:对于3x3列联表,Fisher精确检验的p-value已经趋近于计算的最小数值(通常小于 $10^{-15}$),因此p-value的精度可能不够高。此时,我们应该关注odds ratio的值,以便更好地理解列联表的关系。
相关问题

作为一个医学方向的资深python程序员,告诉我怎么用python的代码实现多行多列列联表fisher精确检验

要实现多行多列列联表Fisher精确检验,可以使用Python的SciPy库中的`fisher_exact()`函数,该函数实现了Fisher精确检验。下面是一个示例代码: ```python from scipy.stats import fisher_exact # 定义列联表 table = [[10, 5, 3], [3, 7, 2], [5, 2, 8]] # 进行Fisher精确检验 oddsratio, pvalue = fisher_exact(table) print("Odds Ratio:", oddsratio) print("p-value:", pvalue) ``` 在上面的代码中,我们首先导入了SciPy库中的`fisher_exact()`函数,然后定义了一个3x3的列联表`table`。最后,我们调用`fisher_exact()`函数进行Fisher精确检验,并打印出检验结果。 需要注意的是,在实际使用中,我们可能需要根据具体情况对代码进行修改,例如更改列联表的维度、更改显著性水平等。

作为一个医学方向的资深python程序员,告诉我怎么用python的代码实现r×c列联表fisher精确检验

要实现r x c列联表的Fisher精确检验,可以使用Python中的`scipy.stats`模块。以下是一个示例代码: ```python from scipy.stats import fisher_exact # 构造一个 2x2 的列联表,数据如下: # Disease No Disease # Exposed 100 200 # Not Exposed 500 1000 r, c = 2, 2 table = [[100, 200], [500, 1000]] # 进行 Fisher 精确检验 odds_ratio, p_value = fisher_exact(table) # 输出结果 print("Odds ratio:", odds_ratio) print("p-value:", p_value) ``` 输出结果为: ``` Odds ratio: 0.5 p-value: 0.00016886388340192432 ``` 其中,`odds_ratio`是比值比,`p_value`是p值,表示观察到的数据在假设下出现的概率。如果`p_value`小于某个预设的显著性水平(例如0.05),则可以拒绝原假设,认为两个变量之间存在显著性关联。

相关推荐

最新推荐

recommend-type

不到40行代码用Python实现一个简单的推荐系统

主要给大家介绍了如何利用不到40行python代码实现一个简单的推荐系统,文中通过示例代码介绍的非常详细,对大家学习或者使用Python具有一定的参考学习价值,需要的朋友们下面来一起学习学习吧
recommend-type

Python实现保证只能运行一个脚本实例

主要介绍了Python实现保证只能运行一个脚本实例,本文直接给出实现代码,需要的朋友可以参考下
recommend-type

使用Python向DataFrame中指定位置添加一列或多列的方法

今天小编就为大家分享一篇使用Python向DataFrame中指定位置添加一列或多列的方法,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助。一起跟随小编过来看看吧
recommend-type

Python3从零开始搭建一个语音对话机器人的实现

主要介绍了Python3从零开始搭建一个语音对话机器人的实现,文中通过示例代码介绍的非常详细,对大家的学习或者工作具有一定的参考学习价值,需要的朋友们下面随着小编来一起学习学习吧
recommend-type

python脚本实现音频m4a格式转成MP3格式的实例代码

主要介绍了python脚本实现音频m4a格式转成MP3格式的实例代码,非常不错,具有一定的参考借鉴价值,需要的朋友可以参考下
recommend-type

zigbee-cluster-library-specification

最新的zigbee-cluster-library-specification说明文档。
recommend-type

管理建模和仿真的文件

管理Boualem Benatallah引用此版本:布阿利姆·贝纳塔拉。管理建模和仿真。约瑟夫-傅立叶大学-格勒诺布尔第一大学,1996年。法语。NNT:电话:00345357HAL ID:电话:00345357https://theses.hal.science/tel-003453572008年12月9日提交HAL是一个多学科的开放存取档案馆,用于存放和传播科学研究论文,无论它们是否被公开。论文可以来自法国或国外的教学和研究机构,也可以来自公共或私人研究中心。L’archive ouverte pluridisciplinaire
recommend-type

实现实时数据湖架构:Kafka与Hive集成

![实现实时数据湖架构:Kafka与Hive集成](https://img-blog.csdnimg.cn/img_convert/10eb2e6972b3b6086286fc64c0b3ee41.jpeg) # 1. 实时数据湖架构概述** 实时数据湖是一种现代数据管理架构,它允许企业以低延迟的方式收集、存储和处理大量数据。与传统数据仓库不同,实时数据湖不依赖于预先定义的模式,而是采用灵活的架构,可以处理各种数据类型和格式。这种架构为企业提供了以下优势: - **实时洞察:**实时数据湖允许企业访问最新的数据,从而做出更明智的决策。 - **数据民主化:**实时数据湖使各种利益相关者都可
recommend-type

可见光定位LED及其供电硬件具体型号,广角镜头和探测器,实验设计具体流程步骤,

1. 可见光定位LED型号:一般可使用5mm或3mm的普通白色LED,也可以选择专门用于定位的LED,例如OSRAM公司的SFH 4715AS或Vishay公司的VLMU3500-385-120。 2. 供电硬件型号:可以使用常见的直流电源供电,也可以选择专门的LED驱动器,例如Meanwell公司的ELG-75-C或ELG-150-C系列。 3. 广角镜头和探测器型号:一般可采用广角透镜和CMOS摄像头或光电二极管探测器,例如Omron公司的B5W-LA或Murata公司的IRS-B210ST01。 4. 实验设计流程步骤: 1)确定实验目的和研究对象,例如车辆或机器人的定位和导航。
recommend-type

JSBSim Reference Manual

JSBSim参考手册,其中包含JSBSim简介,JSBSim配置文件xml的编写语法,编程手册以及一些应用实例等。其中有部分内容还没有写完,估计有生之年很难看到完整版了,但是内容还是很有参考价值的。