python批量计算浮点型高光谱数据平均反射率并存储到csv
时间: 2023-05-27 11:01:57 浏览: 54
import numpy as np
import csv
# 读取数据
data = np.loadtxt('data.txt', delimiter=',')
# 计算平均反射率
average_reflectance = np.mean(data, axis=1)
# 存储数据到csv文件
with open('average_reflectance.csv', mode='w', newline='') as file:
writer = csv.writer(file)
writer.writerow(['Sample', 'Average Reflectance'])
for i in range(len(average_reflectance)):
writer.writerow([f'Sample_{i+1}', average_reflectance[i]])
相关问题
python批量提取浮点型高光谱平均反射率并存储到csv
文件中
假设你已经有了一张高光谱图像,其中每个像素点都对应着不同波段的反射率值。现在,要批量提取每个波段的平均反射率,并将这些数据存储到一个CSV文件中。
下面是一种可能的实现方式:
```python
import numpy as np
import pandas as pd
# 读取高光谱图像数据
image = np.load('image.npy')
# 获取图像的形状和波段数
height, width, num_bands = image.shape
# 初始化一个空的DataFrame,用于存储每个波段的平均反射率数据
df = pd.DataFrame(columns=['Band', 'Mean Reflectance'])
# 遍历每个波段
for band in range(num_bands):
# 提取该波段所有像素点的反射率值,并计算平均值
reflectances = image[:, :, band].reshape((height*width,))
mean_reflectance = np.mean(reflectances)
# 将该波段的平均反射率数据添加到DataFrame中
df.loc[band] = [band, mean_reflectance]
# 将DataFrame保存到CSV文件中
df.to_csv('mean_reflectances.csv', index=False)
```
这段代码首先从一个`.npy`文件中读取高光谱图像数据,并使用`np.shape`函数获取其形状和波段数。然后,它初始化一个空的`DataFrame`对象,用于存储每个波段的平均反射率数据。接下来,它使用一个`for`循环遍历每个波段,提取该波段所有像素点的反射率值,并计算平均值。最后,它将每个波段的平均反射率数据添加到`DataFrame`中,并将`DataFrame`保存到CSV文件中。
python批量提取多个浮点型高光谱文件平均反射率并存储到csv
可以使用Python中的pandas和numpy库来实现批量提取高光谱文件的平均反射率,并将结果存储为csv文件。
首先,需要引入所需库:
```python
import os
import pandas as pd
import numpy as np
```
然后,定义一个函数,用于读取高光谱文件并计算平均反射率。
```python
def process_file(filepath):
data = pd.read_csv(filepath, header=None, delim_whitespace=True)
# 这里根据数据格式修改header和delim_whitespace参数
average_reflectance = np.average(data.iloc[:, 1:].values, axis=1)
# 取第2列到最后一列的数据计算平均值
return average_reflectance
```
接着,定义一个函数来扫描指定目录下的所有高光谱文件,并将计算得到的平均反射率存储到一个列表中。
```python
def batch_process_files(folder):
file_list = os.listdir(folder)
average_reflectances = []
for file in file_list:
filepath = os.path.join(folder, file)
if os.path.isfile(filepath) and file.endswith('.txt'):
average_reflectance = process_file(filepath)
average_reflectances.append(average_reflectance)
print(f'Processed {filepath}')
return average_reflectances
```
最后,将结果存储到csv文件中。
```python
folder = 'path/to/files/'
output_filename = 'output.csv'
average_reflectances = batch_process_files(folder)
output_data = pd.DataFrame(average_reflectances)
output_data.to_csv(output_filename, index=False, header=False)
print(f'Saved output to {output_filename}')
```
完整代码:
```python
import os
import pandas as pd
import numpy as np
def process_file(filepath):
data = pd.read_csv(filepath, header=None, delim_whitespace=True)
average_reflectance = np.average(data.iloc[:, 1:].values, axis=1)
return average_reflectance
def batch_process_files(folder):
file_list = os.listdir(folder)
average_reflectances = []
for file in file_list:
filepath = os.path.join(folder, file)
if os.path.isfile(filepath) and file.endswith('.txt'):
average_reflectance = process_file(filepath)
average_reflectances.append(average_reflectance)
print(f'Processed {filepath}')
return average_reflectances
folder = 'path/to/files/'
output_filename = 'output.csv'
average_reflectances = batch_process_files(folder)
output_data = pd.DataFrame(average_reflectances)
output_data.to_csv(output_filename, index=False, header=False)
print(f'Saved output to {output_filename}')
```