根据匹配好的乳腺癌数据BCdata.csv,从给定的569个数据样本中随机抽取400个样本 作为训练集,其余样本作为测试集,建立基于AdaBoost的乳腺癌预测模型,计算预测准确率、感敏度和特异度,并绘制ROC曲线

时间: 2024-04-07 14:30:43 浏览: 11
好的,我明白了您的要求。下面我将会给出具体的步骤: 1. 数据处理和分割 首先,我们需要加载数据并对其进行处理和分割。您提供的数据集 BCdata.csv 包含了569个数据样本,每个样本有30个特征和一个二元标签。我们需要将数据分为训练集和测试集,并将其准备为AdaBoost算法可以使用的格式。下面是处理和分割数据的代码: ```python import pandas as pd from sklearn.model_selection import train_test_split # 加载数据 data = pd.read_csv("BCdata.csv") # 将标签转换为0和1 data['diagnosis'] = data['diagnosis'].map({'M': 1, 'B': 0}) # 分割数据集 train_data, test_data, train_label, test_label = train_test_split(data.iloc[:, 1:], data.iloc[:, 0], test_size=0.3, random_state=0) ``` 2. 建立AdaBoost模型 AdaBoost是一种基于集成学习的分类算法,它会通过多次迭代训练弱分类器,最终组合成一个强分类器。我们将使用sklearn库中的AdaBoostClassifier类来建立模型。 ```python from sklearn.ensemble import AdaBoostClassifier from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier # 建立决策树分类器 tree = DecisionTreeClassifier(max_depth=1) # 建立AdaBoost模型 ada = AdaBoostClassifier(base_estimator=tree, n_estimators=100) # 训练模型 ada.fit(train_data, train_label) ``` 3. 评估模型性能 在训练完成后,我们需要对模型进行评估。我们将使用准确率、感敏度和特异度来评估模型的性能,并绘制ROC曲线。 ```python from sklearn.metrics import accuracy_score, confusion_matrix, roc_curve, auc # 预测测试集 pred = ada.predict(test_data) # 计算准确率 accuracy = accuracy_score(test_label, pred) # 计算混淆矩阵 tn, fp, fn, tp = confusion_matrix(test_label, pred).ravel() # 计算感敏度和特异度 sensitivity = tp / (tp + fn) specificity = tn / (tn + fp) # 计算ROC曲线和AUC fpr, tpr, thresholds = roc_curve(test_label, ada.predict_proba(test_data)[:, 1]) roc_auc = auc(fpr, tpr) print("准确率:", accuracy) print("感敏度:", sensitivity) print("特异度:", specificity) print("AUC:", roc_auc) # 绘制ROC曲线 import matplotlib.pyplot as plt plt.plot(fpr, tpr, label='ROC curve (area = %0.2f)' % roc_auc) plt.plot([0, 1], [0, 1], 'k--') plt.xlim([0.0, 1.0]) plt.ylim([0.0, 1.05]) plt.xlabel('False Positive Rate') plt.ylabel('True Positive Rate') plt.title('ROC Curve') plt.legend(loc="lower right") plt.show() ``` 完成以上步骤后,我们就得到了基于AdaBoost的乳腺癌预测模型,并且计算了预测准确率、感敏度、特异度和AUC,并绘制了ROC曲线。

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