geom_errorbar(aes(ymax=bm+se,ymin=bm-se),position=position_dodge(0.9)
时间: 2024-04-24 22:22:52 浏览: 108
这是一个ggplot2中的geom_errorbar函数的参数设置,用于绘制误差棒图。其中,aes(ymax=bm+se,ymin=bm-se)表示将y轴上限和下限分别设置为bm+se和bm-se,其中bm是平均值,se是标准误差;position=position_dodge(0.9)表示将误差棒图分开排列,避免重叠。这个参数设置通常是与geom_bar函数一起使用,用于在柱状图上绘制误差棒。
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bplot<-read.csv("eplot.csv",header=T) ggplot(data=bplot,aes(x=ss, y=bm, fill= mac))+geom_bar(stat="identity",position="dodge")+ge om_errorbar(aes(ymax=bm+se,ymin=bm-se),position=position_dodge(0.9), width=0.15)+scale _fill_brewer(palette = "Set1")+geom_text (aes(y=bm+se+0.2,label=t),position=position_dod ge(0.9), size=3)+ylab("biomass (g)")+facet_grid('. ~ group')
这段代码主要用于绘制带误差条的堆积柱状图。具体解释如下:
1. `bplot <- read.csv("eplot.csv", header = T)` 读取名为 "eplot.csv" 的数据文件,将其存储在名为 `bplot` 的数据框中。
2. `ggplot(data = bplot, aes(x = ss, y = bm, fill = mac))` 创建一个基础绘图对象,数据来源是 `bplot` 数据框,`x` 轴映射到 `ss` 列,`y` 轴映射到 `bm` 列,`fill` 映射到 `mac` 列。
3. `+ geom_bar(stat = "identity", position = "dodge")` 添加一个堆积柱状图层,统计量为 "identity",位置为 "dodge",即堆积。
4. `+ geom_errorbar(aes(ymax = bm + se, ymin = bm - se), position = position_dodge(0.9), width = 0.15)` 添加一个误差条层,`ymax` 映射到 `bm + se` 列,`ymin` 映射到 `bm - se` 列,位置与堆积柱状图层相同,宽度为 0.15。
5. `+ scale_fill_brewer(palette = "Set1")` 设置填充颜色的调色板为 "Set1"。
6. `+ geom_text(aes(y = bm + se + 0.2, label = t), position = position_dodge(0.9), size = 3)` 添加一个文本层,`y` 映射到 `bm + se + 0.2` 列,标签映射到 `t` 列,位置与堆积柱状图相同,字体大小为 3。
7. `+ ylab("biomass (g)")` 添加 `y` 轴标签。
8. `+ facet_grid('. ~ group')` 根据 `group` 列进行分面,"." 表示只在 `y` 轴方向进行分面。
> bplot <- ggplot(data=data,aes(x=牧食处理, y=总分株数, fill= 品种))+geom_bar(stat="identity",position="dodge")+geom_errorbar(aes(ymax=总分株数+se,ymin=总分株数-se),position=position_dodge(0.9), width=0.15)+scale_fill_brewer(palette = "Set1")+geom_text (aes(y=总分株数+se,label=显著性),position=position_dodge(0.9), size=3)+ylab("分株数(株)")+facet_grid('. ~ 栽培模式')我想把label=显著性,这个标签移到误差棒
可以使用`geom_label()`函数将"label=显著性"的标签移到误差棒上,具体代码如下:
```
bplot <- ggplot(data=data,aes(x=牧食处理, y=总分株数, fill=品种)) +
geom_bar(stat="identity",position="dodge") +
geom_errorbar(aes(ymax=总分株数+se,ymin=总分株数-se),
position=position_dodge(0.9), width=0.15) +
scale_fill_brewer(palette = "Set1") +
ylab("分株数(株)") +
facet_grid('. ~ 栽培模式') +
geom_label(aes(y=总分株数+se, label="显著性"),
position=position_dodge(0.9), size=3)
```
这段代码中,`geom_label()`函数的参数与`geom_text()`函数类似,只是将`label`参数改为了"显著性",并且将`position`参数设为`position_dodge(0.9)`,这样标签就能够和误差棒对齐了。
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