Python运用si感染模型感染导入的'football.edge'数据集,输出打印节点感染状态和邻居,之后设置观测节点,利用反向传播算法来定位,输出结果并将定位结果可视化
时间: 2023-10-06 21:05:57 浏览: 117
Python疫情数据的爬虫和可视化显示
首先,我们需要安装 `networkx` 和 `matplotlib` 库来读取和可视化网络数据。
```python
!pip install networkx matplotlib
```
接着,我们可以使用以下代码读取 `football.edge` 数据集:
```python
import networkx as nx
G = nx.read_edgelist('football.edge', nodetype=int)
```
然后,我们可以使用 `SI` 模型来模拟节点的感染过程:
```python
from collections import deque
def si_model(G, beta):
# 初始时,所有节点都是未感染状态
status = {node: 'S' for node in G.nodes}
# 随机选择一个节点进行感染
start_node = list(G.nodes)[0]
status[start_node] = 'I'
# 使用队列来维护感染节点的集合
infected_nodes = deque([start_node])
# 感染传播
while infected_nodes:
node = infected_nodes.popleft()
for neighbor in G.neighbors(node):
if status[neighbor] == 'S':
if random.random() < beta:
status[neighbor] = 'I'
infected_nodes.append(neighbor)
return status
```
现在我们可以使用 `si_model` 函数来模拟节点的感染过程,并打印节点的感染状态和邻居:
```python
import random
# 使用 beta=0.5 进行感染模拟
status = si_model(G, 0.5)
# 打印节点的感染状态和邻居
for node in G.nodes:
print(f'Node {node}: {status[node]}')
print(f'Neighbors: {list(G.neighbors(node))}')
```
接下来,我们可以设置观测节点,并使用反向传播算法来进行节点定位:
```python
def reverse_si_model(G, beta, observed_nodes):
# 初始时,所有节点都是未感染状态
status = {node: 'S' for node in G.nodes}
# 观测节点的初始状态为感染状态
for node in observed_nodes:
status[node] = 'I'
# 使用队列来维护感染节点的集合
infected_nodes = deque(observed_nodes)
# 感染传播
while infected_nodes:
node = infected_nodes.popleft()
for neighbor in G.neighbors(node):
if status[neighbor] == 'S':
if random.random() < beta:
status[neighbor] = 'I'
infected_nodes.append(neighbor)
return status
```
我们可以使用以下代码来进行节点定位:
```python
# 设置观测节点
observed_nodes = [1, 10, 20, 30]
# 使用 beta=0.5 进行反向传播算法定位
status = reverse_si_model(G, 0.5, observed_nodes)
# 打印定位结果
for node in G.nodes:
if status[node] == 'I':
print(f'Node {node} is infected.')
```
最后,我们可以使用 `matplotlib` 库来可视化节点的感染状态。以下代码将感染节点标记为红色,未感染节点标记为蓝色:
```python
import matplotlib.pyplot as plt
# 将感染节点的位置设置为红色,未感染节点的位置设置为蓝色
colors = ['r' if status[node] == 'I' else 'b' for node in G.nodes]
# 可视化网络
nx.draw(G, pos=nx.spring_layout(G), node_color=colors)
plt.show()
```
完整代码如下:
阅读全文