Python运用si感染模型感染导入的'football.edge'数据集,输出打印节点感染状态和邻居,之后设置观测节点,利用反向传播算法来定位,输出结果并将定位结果可视化

时间: 2023-10-06 21:05:57 浏览: 117
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Python疫情数据的爬虫和可视化显示

首先,我们需要安装 `networkx` 和 `matplotlib` 库来读取和可视化网络数据。 ```python !pip install networkx matplotlib ``` 接着,我们可以使用以下代码读取 `football.edge` 数据集: ```python import networkx as nx G = nx.read_edgelist('football.edge', nodetype=int) ``` 然后,我们可以使用 `SI` 模型来模拟节点的感染过程: ```python from collections import deque def si_model(G, beta): # 初始时,所有节点都是未感染状态 status = {node: 'S' for node in G.nodes} # 随机选择一个节点进行感染 start_node = list(G.nodes)[0] status[start_node] = 'I' # 使用队列来维护感染节点的集合 infected_nodes = deque([start_node]) # 感染传播 while infected_nodes: node = infected_nodes.popleft() for neighbor in G.neighbors(node): if status[neighbor] == 'S': if random.random() < beta: status[neighbor] = 'I' infected_nodes.append(neighbor) return status ``` 现在我们可以使用 `si_model` 函数来模拟节点的感染过程,并打印节点的感染状态和邻居: ```python import random # 使用 beta=0.5 进行感染模拟 status = si_model(G, 0.5) # 打印节点的感染状态和邻居 for node in G.nodes: print(f'Node {node}: {status[node]}') print(f'Neighbors: {list(G.neighbors(node))}') ``` 接下来,我们可以设置观测节点,并使用反向传播算法来进行节点定位: ```python def reverse_si_model(G, beta, observed_nodes): # 初始时,所有节点都是未感染状态 status = {node: 'S' for node in G.nodes} # 观测节点的初始状态为感染状态 for node in observed_nodes: status[node] = 'I' # 使用队列来维护感染节点的集合 infected_nodes = deque(observed_nodes) # 感染传播 while infected_nodes: node = infected_nodes.popleft() for neighbor in G.neighbors(node): if status[neighbor] == 'S': if random.random() < beta: status[neighbor] = 'I' infected_nodes.append(neighbor) return status ``` 我们可以使用以下代码来进行节点定位: ```python # 设置观测节点 observed_nodes = [1, 10, 20, 30] # 使用 beta=0.5 进行反向传播算法定位 status = reverse_si_model(G, 0.5, observed_nodes) # 打印定位结果 for node in G.nodes: if status[node] == 'I': print(f'Node {node} is infected.') ``` 最后,我们可以使用 `matplotlib` 库来可视化节点的感染状态。以下代码将感染节点标记为红色,未感染节点标记为蓝色: ```python import matplotlib.pyplot as plt # 将感染节点的位置设置为红色,未感染节点的位置设置为蓝色 colors = ['r' if status[node] == 'I' else 'b' for node in G.nodes] # 可视化网络 nx.draw(G, pos=nx.spring_layout(G), node_color=colors) plt.show() ``` 完整代码如下:
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