怎么得到差异基因表达的数据，R语言

要进行差异基因表达分析，首先需要获得基因表达谱数据。基因表达谱数据可以从公共数据库中下载，例如GEO、TCGA、ENCODE等，也可以通过RNA测序实验获得。如果您已经获得了基因表达谱数据，可以使用以下代码将其导入到R中：

# 导入表达谱数据
data <- read.table("expression_data.txt", header=TRUE, row.names=1)

其中，"expression_data.txt"为基因表达谱数据的文件名，文件格式为txt格式，第一行为列名，第一列为基因名。

如果您使用的是RNA测序数据，可以使用以下代码将其转化为基因表达谱数据：

# 导入RNA测序数据
library(Rsubread)
counts <- featureCounts(files=list("sample1.bam", "sample2.bam"), annot.ext="gene.gtf", isGTFAnnotationFile=TRUE)
data <- counts$counts
rownames(data) <- counts$annotation$gene_id

其中，"sample1.bam"和"sample2.bam"为RNA测序数据的文件名，"gene.gtf"为参考基因组注释文件。使用featureCounts()函数从RNA测序数据中提取基因计数，然后将其转化为基因表达谱数据并导入到R中。

导入数据后，就可以进行后续的差异基因表达分析了。