编写python代码进行图像中细胞的分析处理,要求进行图像分割,将图像中细胞分割为两类或三类,细胞计数,重叠或粘连的细胞要计数成多个;不完整的细胞记成一个;最后进行半径计算

时间: 2023-02-07 08:56:09 浏览: 67
这是一个相当大的问题,因此我将分成几个部分来回答: - 如何将图像分成两类或三类 - 如何计算细胞的数量 - 如何计算细胞的半径 首先,我们需要导入必要的库: ```python import cv2 import numpy as np ``` 接下来,我们可以使用 OpenCV 库中的分水岭算法来将图像分割为两类或三类。分水岭算法可以找到图像中的轮廓,然后将轮廓内部和轮廓外部分割成两部分。 这里是一个例子,假设我们已经读入了图像,并将其存储在变量 `img` 中: ```python gray = cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_BGR2GRAY) ret, thresh = cv2.threshold(gray, 0, 255, cv2.THRESH_BINARY_INV+cv2.THRESH_OTSU) # noise removal kernel = np.ones((3,3),np.uint8) opening = cv2.morphologyEx(thresh,cv2.MORPH_OPEN,kernel, iterations = 2) # sure background area sure_bg = cv2.dilate(opening,kernel,iterations=3) # Finding sure foreground area dist_transform = cv2.distanceTransform(opening,cv2.DIST_L2,5) ret, sure_fg = cv2.threshold(dist_transform,0.7*dist_transform.max(),255,0) # Finding unknown region sure_fg = np.uint8(sure_fg) unknown = cv2.subtract(sure_bg,sure_fg) ``` 这将生成三个变量:`sure_bg`(背景)、`sure_fg`(前景)和 `unknown`(未知区域)。 接下来,我们可以使用分水岭算法将图像分成

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