ubuntu安装deepchem
时间: 2024-01-07 18:04:01 浏览: 146
要在Ubuntu上安装DeepChem,您可以按照以下步骤进行操作:
1. 首先,您需要下载MGLtools安装包。您可以从https://ccsb.scripps.edu/mgltools/downloads/ 下载mgltools_x86_64Linux2_1.5.7.tar.gz (Linux 64 tarball installer 108Mb)安装包。\[3\]
2. 下载完成后,解压缩安装包并进入解压后的目录。
3. 打开终端,并使用sudo权限编辑~/.bashrc文件,添加以下内容来设置环境变量和别名:
```
export PATH=/path/to/mgltools_x86_64Linux2_1.5.7/bin:$PATH
alias pmv='/path/to/mgltools_x86_64Linux2_1.5.7/bin/pmv'
alias adt='/path/to/mgltools_x86_64Linux2_1.5.7/bin/adt'
alias vision='/path/to/mgltools_x86_64Linux2_1.5.7/bin/vision'
alias pythonsh='/path/to/mgltools_x86_64Linux2_1.5.7/bin/pythonsh'
```
请将上述命令中的`/path/to/`替换为您解压缩MGLtools安装包的路径。\[1\]
4. 编辑DeepChem的启动脚本,将第一行替换为:
```
#!/usr/bin/env /path/to/mgltools_x86_64Linux2_1.5.7/bin/python
```
同样,请将上述命令中的`/path/to/`替换为您解压缩MGLtools安装包的路径。\[2\]
5. 保存并关闭~/.bashrc文件。
6. 在终端中运行以下命令使更改生效:
```
source ~/.bashrc
```
现在,您应该已经成功安装了DeepChem。您可以在终端中运行相关命令来使用DeepChem进行分子计算和化学模拟。
#### 引用[.reference_title]
- *1* *2* *3* [使用Autodock Vina进行分子对接](https://blog.csdn.net/wufeil7/article/details/121964144)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^insertT0,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item]
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