File "/h/ziyang/project/rbp_boxplot.py", line 48, in <module> File "/h/ziyang/project/rbp_boxplot.py", line 34, in create_boxplot NameError: name 'subfolder' is not defined 依旧出现这个问题
时间: 2024-02-05 09:03:29 浏览: 34
非常抱歉,我之前给出的解决方案有误导性,导致仍然存在 `NameError` 错误。这是因为在 `create_boxplot` 函数中,我们没有传递 `subfolders` 列表作为参数,导致 `subfolder` 变量未定义。
为了解决这个问题,我们需要将 `subfolders` 列表作为参数传递给 `create_boxplot` 函数,并在函数内部使用它。请修改 `create_boxplot` 函数的定义和调用,如下所示:
```python
def create_boxplot(rbp_name, data, subfolders):
fig, ax = plt.subplots()
ax.boxplot(data)
x_labels = []
for subfolder in subfolders:
x_labels.extend([f'Ctrl_{subfolder}', f'rep1_{subfolder}', f'rep2_{subfolder}'])
ax.set_xticklabels(x_labels, rotation=45)
plt.savefig(os.path.join(rbp_name, f'{rbp_name}_boxplot.pdf'))
plt.close()
# ...
if __name__ == "__main__":
rbp_name = sys.argv[1]
subfolders = ['lncRNA', 'miRNA', 'mRNA', 'snoRNA', 'snRNA', 'tRNA']
# 提取数据
data = extract_data(rbp_name)
# 创建箱线图
create_boxplot(rbp_name, data, subfolders)
```
通过将 `subfolders` 列表作为参数传递给 `create_boxplot` 函数,并在函数内部使用循环来生成 x 轴标签,我们可以解决 `NameError` 错误。请尝试运行修改后的代码,看看问题是否解决了。如果还有其他问题,请随时提问。