if __name__ == '__main__': # -------------Adjustable global parameters---------- n=512 # pixel number m=10 # number of time phases angle = 5 # #sample points = 360/angle on the boundary numOfAngles = int(180/angle) numOfContourPts = int(360/angle) labelID = 1 # 勾画的RS文件中第几个轮廓为GTV # path of the input data folder = 'E:\\MedData\\4DCT-202305\\' #patient = '0007921948' # 缺少时间信息 patient = '0000726380' # 病人的编号 # 呼吸曲线数据文件 vxpPath = folder+patient+'\\0000726380\\0000726380_20230420_143723.vxp' # Save the generated figures to the latex file path figPath = "D:\\HUNNU\\Research\\DMD\\4D-CT\\latex-DMD插值\\modify202305\\figure\\" # -------------Auto generated global parameters---------- # 每个dicom文件包含多少横截面 name = os.listdir(folder+patient+'\\0') cuts = [] for i in range(len(name)): if 'CT' in name[i][0:2]: cuts.append(i+1) cuts = np.array(cuts) # phase name times = np.linspace(0,90,10) # image pixel coordinate nums = np.linspace(0,n-1,n) x,y = np.meshgrid(nums,nums) # 输出dicom头文件信息 filename = folder+patient+'\\0\\CT.{}'.format(patient)+'.Image 1.dcm' print('CT dicom file information:') info = loadFileInformation(filename) # 像素之间的间距,包括列间距和行间距,单位mm SliceThickness = info['SliceThickness'] # Z轴的扫描分辨率,单位mm pixelSpace = info['pixelSpace'] # 一个像素所占的实际体积 pixelVol = float(pixelSpace[0])*float(pixelSpace[0])*float(SliceThickness) print('sliceThickness=',SliceThickness,' pixelSpace=',pixelSpace)

时间: 2024-02-29 22:55:52 浏览: 18
这段代码是一个 Python 脚本中的主函数部分。代码中定义了一些可调整的全局参数,例如像素数目、时间相位数目、采样点角度等。然后根据给定的病人信息和文件路径,读取 DICOM 文件并获取一些头文件信息,例如像素间距、扫描分辨率等。最后打印输出这些信息。 需要注意的是,这段代码中存在一些依赖的库和函数,例如 `os`、`np`、`loadFileInformation` 等。在运行代码之前需要确保这些依赖已经被正确安装和导入。
相关问题

set_aspect()

`set_aspect()` 方法用于设置 Axes 对象的长宽比。具体来说,它可以接受以下参数: - `aspect`:长宽比,可以是一个数值或者字符串。如果是数值,则表示横轴长度和纵轴长度的比值。如果是字符串,则可以是以下值之一: - `'equal'`:长宽比为1:1。 - `'auto'`:自动根据数据范围和图形大小来调整长宽比。 - `'datalim'`:根据数据范围来设置长宽比。 - `adjustable`:调整方式,可以是以下值之一: - `'box'`:保持长宽比,但是可能会超出数据范围。 - `'datalim'`:根据数据范围来调整长宽比。 - `'box-forced'`:强制保持长宽比,并且不超出数据范围。 - `anchor`:参考点,可以是以下值之一: - `'C'`:中心点。 - `'SW'`:左下角。 - `'S'`:下中心点。 - `'SE'`:右下角。 - `'E'`:右中心点。 - `'NE'`:右上角。 - `'N'`:上中心点。 - `'NW'`:左上角。 例如,如果要将 Axes 对象的长宽比设置为 2:1,可以这样写: ```python ax.set_aspect(2) ``` 如果要将长宽比设置为 1:1,可以这样写: ```python ax.set_aspect('equal') ```

ValueError: 'box' is not a valid value for adjustable; supported values are 'box-forced', 'datalim'

在 Matplotlib 绘制图形时出现 `ValueError: 'box' is not a valid value for adjustable; supported values are 'box-forced', 'datalim'` 错误,是因为 `ax.set_aspect()` 函数的 `adjustable` 参数传入了错误的值。 `ax.set_aspect()` 函数用于设置坐标轴的宽高比。其中 `adjustable` 参数用于控制坐标轴的可调性,支持的值有 `'box-forced'` 和 `'datalim'`。当该参数的值为 `'box'` 时,就会出现上述错误。 解决方法是将 `adjustable` 参数的值改为 `'box-forced'` 或 `'datalim'`,例如: ```python ax.set_aspect('box-forced') ``` 或者 ```python ax.set_aspect('datalim') ``` 这样就可以避免出现该错误。

相关推荐

for Itr=1:Max_Itr for i=1:nop % Determin RSs and Search by LTs %-------------------------------------------------------- Rf=((i-1)/(nop-1))(RM-Rm)+Rm; Rd=norm(GOP-GTs(:,RKs(i))); Rs=Rf(Rf>=Rd)+Rd*(Rd>Rf); LTs_C=Create_LTs(No_LTs,Rs,Dim); LTs=repmat(GTs(:,RKs(i)),1,No_LTs)+LTs_C; LTs=SS(LTs,Par_Interval); %---------------- if Graphic_on==1 subplot(2,2,1) hold off pause(0.000001); plot(LTs(1,:),LTs(2,:),'x'); hold on ezplot(['(x-' num2str(GTs(1,RKs(i))) ')^2 + (y-' num2str(GTs(2,RKs(i))) ')^2 -' num2str(Rs^2)],[0 10],[0 10]); hold off xlim([Par_Interval(1,1) Par_Interval(1,2)]); ylim([Par_Interval(2,1) Par_Interval(2,2)]); pbaspect([1 1 1]) title('Local Search') xlabel('x_1') ylabel('x_2') end %---------------- LTs_Cost=Ev_Fcn(LTs,Fcn_Name); [L_min,L_inx]= min(LTs_Cost); if L_min<=LP_Cost(RKs(i)) LP(:,RKs(i))=LTs(:,L_inx); LP_Cost(RKs(i))=L_min; end if L_min<=GOP_Cost GOP_Cost=L_min; GOP=LTs(:,L_inx); end end % Search by GTs %-------------------------------------------------------- for i=1:nop GTs(:,i)=New_GT(GTs(:,i),LP(:,i),GOP,Lambda,Theta,Beta); GTs(:,i)=SS(GTs(:,i),Par_Interval); GTs_Cost(i)=Ev_Fcn(GTs(:,i),Fcn_Name); end % Ranking %-------------------------------------------------------- [Gts_Sorted,RKs]=sort(GTs_Cost); GOP_B=GTs(:,RKs(1)); GOP_Cost_B=Gts_Sorted(1); if GOP_Cost_B<=GOP_Cost GOP_Cost=GOP_Cost_B; GOP=GOP_B; end OP_Cost(Itr+1)=GOP_Cost; %---------------- if Graphic_on==1 subplot(2,2,2) hold off pause(.000001) plot(GTs(1,:),GTs(2,:),'*') hold on plot(GOP(1,:),GOP(2,:),'X','color','red') xlim([Par_Interval(1,1) Par_Interval(1,2)]); ylim([Par_Interval(2,1) Par_Interval(2,2)]); hold off pbaspect([1 1 1]*3) title('Global Search') xlabel('x_1') ylabel('x_2') end %---------------- %---------------- if Graphic_on==1 subplot(2,2,3) hold off pause(.000001) plot(OP_Cost(1:Itr+1)) pbaspect([2 1 1]) xlim([1 Max_Itr+1]) title(['Cost=' num2str(GOP_Cost,'%4.10f')]) xlabel('Iteration') ylabel('Cost') else hold off pause(.000001) plot(0:Itr,OP_Cost(1:Itr+1),'.','MarkerSize',15,'LineStyle','-','Color',[214 30 0]/255,'MarkerEdgeColor',[3 93 118]/255) pbaspect([2 1 1]) title(['Itr=' num2str(Itr) ', Cost=' num2str(GOP_Cost,'%4.10f')]) xlim([0 Max_Itr]) xlabel('Iteration') ylabel('Cost') end %---------------- end 把这段MATLAB代码转换为python代码

最新推荐

recommend-type

python自学教程-04-自定义JavaScript.ev4.rar

python自学教程-04-自定义JavaScript.ev4.rar
recommend-type

zigbee-cluster-library-specification

最新的zigbee-cluster-library-specification说明文档。
recommend-type

管理建模和仿真的文件

管理Boualem Benatallah引用此版本:布阿利姆·贝纳塔拉。管理建模和仿真。约瑟夫-傅立叶大学-格勒诺布尔第一大学,1996年。法语。NNT:电话:00345357HAL ID:电话:00345357https://theses.hal.science/tel-003453572008年12月9日提交HAL是一个多学科的开放存取档案馆,用于存放和传播科学研究论文,无论它们是否被公开。论文可以来自法国或国外的教学和研究机构,也可以来自公共或私人研究中心。L’archive ouverte pluridisciplinaire
recommend-type

【实战演练】增量式PID的simulink仿真实现

# 2.1 Simulink仿真环境简介 Simulink是MATLAB中用于建模、仿真和分析动态系统的图形化环境。它提供了一个直观的用户界面,允许用户使用块和连接线来创建系统模型。Simulink模型由以下元素组成: - **子系统:**将复杂系统分解成更小的、可管理的模块。 - **块:**代表系统中的组件,如传感器、执行器和控制器。 - **连接线:**表示信号在块之间的流动。 Simulink仿真环境提供了广泛的块库,涵盖了各种工程学科,包括控制系统、电子和机械工程。它还支持用户自定义块的创建,以满足特定仿真需求。 # 2. Simulink仿真环境的搭建和建模 ### 2.
recommend-type

训练集和测试集的准确率都99%,但是预测效果不好

即使训练集和测试集的准确率都很高,但是在实际的预测中表现不佳,可能会有以下几个原因: 1. 数据质量问题:模型训练和测试的数据可能存在问题,比如数据标签错误、数据集采样不均衡、数据集中存在异常值等问题,这些问题可能会导致模型在实际预测中表现不佳。 2. 特征工程问题:模型的特征工程可能存在问题,导致模型无法很好地捕捉数据的特征,从而影响预测效果。 3. 模型选择问题:模型的选择可能不合适,比如选择的模型太简单,无法很好地拟合数据,或者选择的模型太复杂,导致过拟合等问题。 4. 超参数调整问题:模型的超参数可能没有调整到最佳状态,需要进行调整。 针对以上可能的原因,可以采取相应的措施进
recommend-type

JSBSim Reference Manual

JSBSim参考手册,其中包含JSBSim简介,JSBSim配置文件xml的编写语法,编程手册以及一些应用实例等。其中有部分内容还没有写完,估计有生之年很难看到完整版了,但是内容还是很有参考价值的。
recommend-type

"互动学习:行动中的多样性与论文攻读经历"

多样性她- 事实上SCI NCES你的时间表ECOLEDO C Tora SC和NCESPOUR l’Ingén学习互动,互动学习以行动为中心的强化学习学会互动,互动学习,以行动为中心的强化学习计算机科学博士论文于2021年9月28日在Villeneuve d'Asq公开支持马修·瑟林评审团主席法布里斯·勒菲弗尔阿维尼翁大学教授论文指导奥利维尔·皮耶昆谷歌研究教授:智囊团论文联合主任菲利普·普雷教授,大学。里尔/CRISTAL/因里亚报告员奥利维耶·西格德索邦大学报告员卢多维奇·德诺耶教授,Facebook /索邦大学审查员越南圣迈IMT Atlantic高级讲师邀请弗洛里安·斯特鲁布博士,Deepmind对于那些及时看到自己错误的人...3谢谢你首先,我要感谢我的两位博士生导师Olivier和Philippe。奥利维尔,"站在巨人的肩膀上"这句话对你来说完全有意义了。从科学上讲,你知道在这篇论文的(许多)错误中,你是我可以依
recommend-type

【实战演练】MATLAB simulink船舶动力定位模拟器

# 1. MATLAB Simulink 简介** MATLAB Simulink 是 MathWorks 公司开发的一款图形化建模和仿真软件,广泛应用于工程、科学和教育领域。它提供了丰富的模块库和仿真环境,使工程师能够快速构建和仿真复杂系统。 Simulink 的核心概念是基于块状图建模,其中每个模块代表一个特定的功能或组件。用户可以通过拖放模块并连接它们来创建系统模型。Simulink 提供了广泛的模块库,涵盖了信号处理、控制系统、动力学和通信等领域。 此外,Simulink 还支持自定义模块开发,允许用户创建自己的模块来扩展其功能。这使得 Simulink 成为一个高度灵活的仿真平
recommend-type

linux下RS485怎么实现

在Linux下实现RS485通信,需要做以下几个步骤: 1. 确认硬件支持:首先需要确认通信设备硬件是否支持RS485通信,如果不支持需要更换支持RS485通信的硬件设备。 2. 配置串口参数:在Linux下使用RS485通信,需要对串口进行一些特殊的配置。例如,需要将串口设置为半双工模式、开启硬件流控等。可以使用Linux提供的stty命令或者相关API接口进行配置。 3. 编写应用程序:通过Linux提供的串口API接口,编写应用程序实现RS485通信。在应用程序中需要设置对应的串口参数,以及发送和接收数据的逻辑。 4. 配置硬件电平转换器:在使用RS485通信时,需要将串口的逻辑
recommend-type

c++校园超市商品信息管理系统课程设计说明书(含源代码) (2).pdf

校园超市商品信息管理系统课程设计旨在帮助学生深入理解程序设计的基础知识,同时锻炼他们的实际操作能力。通过设计和实现一个校园超市商品信息管理系统,学生掌握了如何利用计算机科学与技术知识解决实际问题的能力。在课程设计过程中,学生需要对超市商品和销售员的关系进行有效管理,使系统功能更全面、实用,从而提高用户体验和便利性。 学生在课程设计过程中展现了积极的学习态度和纪律,没有缺勤情况,演示过程流畅且作品具有很强的使用价值。设计报告完整详细,展现了对问题的深入思考和解决能力。在答辩环节中,学生能够自信地回答问题,展示出扎实的专业知识和逻辑思维能力。教师对学生的表现予以肯定,认为学生在课程设计中表现出色,值得称赞。 整个课程设计过程包括平时成绩、报告成绩和演示与答辩成绩三个部分,其中平时表现占比20%,报告成绩占比40%,演示与答辩成绩占比40%。通过这三个部分的综合评定,最终为学生总成绩提供参考。总评分以百分制计算,全面评估学生在课程设计中的各项表现,最终为学生提供综合评价和反馈意见。 通过校园超市商品信息管理系统课程设计,学生不仅提升了对程序设计基础知识的理解与应用能力,同时也增强了团队协作和沟通能力。这一过程旨在培养学生综合运用技术解决问题的能力,为其未来的专业发展打下坚实基础。学生在进行校园超市商品信息管理系统课程设计过程中,不仅获得了理论知识的提升,同时也锻炼了实践能力和创新思维,为其未来的职业发展奠定了坚实基础。 校园超市商品信息管理系统课程设计的目的在于促进学生对程序设计基础知识的深入理解与掌握,同时培养学生解决实际问题的能力。通过对系统功能和用户需求的全面考量,学生设计了一个实用、高效的校园超市商品信息管理系统,为用户提供了更便捷、更高效的管理和使用体验。 综上所述,校园超市商品信息管理系统课程设计是一项旨在提升学生综合能力和实践技能的重要教学活动。通过此次设计,学生不仅深化了对程序设计基础知识的理解,还培养了解决实际问题的能力和团队合作精神。这一过程将为学生未来的专业发展提供坚实基础,使其在实际工作中能够胜任更多挑战。