如何使用R语言中的kmeans()函数对Iris鸢尾花数据集进行聚类分析,并分别比较K-means、层次聚类(hclust)和DBSCAN等不同聚类方法的聚类效果及可视化结果?
时间: 2024-12-24 19:39:44 浏览: 10
在R语言中,我们可以使用`kmeans()`函数对Iris数据集进行K-means聚类分析。以下是基本步骤:
1. 首先,加载必要的包和数据集:
```r
library(ggplot2)
library(cluster)
data(iris)
```
2. 对数据进行预处理,移除非数值列(如Species):
```r
iris_kmeans <- iris[, 1:4]
```
3. 定义簇的数量(K值),比如我们设为3:
```r
k <- 3
kmeans_model <- kmeans(iris_kmeans, centers = k)
```
4. 分析结果:
```r
summary(kmeans_model)
```
5. 可视化结果:
```r
ggplot(data = data.frame(x = iris_kmeans[,1], y = iris_kmeans[,2], cluster = as.factor(kmeans_model$cluster)), aes(x=x, y=y, color=cluster)) + geom_point()
```
接下来,我们可以比较其他聚类方法:
- **层次聚类 (hclust)**:使用`hclust()`和`cutree()`函数创建树状图,然后可视化工序。层次聚类的结果通常是一个树形结构,需要选择合适的剪枝点(即簇数)。
- **DBSCAN**:使用`dbscan()`函数,它不需要预先设定簇的数量。结果会返回每个点的类别和邻域半径。可以使用`silhouette()`函数计算DBSCAN的轮廓系数来评估聚类质量。
在可视化上,通常使用散点图(Scatter Plot)表示样本分布,并用颜色区分不同的聚类。对于K-means,颜色将根据分配的簇进行编码;层次聚类和DBSCAN通常用颜色标记不同的聚类区域。
比较聚类效果可以从以下几个方面入手:
- 簇内离散度:查看各个簇内部的距离是否均匀,越均匀说明聚类效果越好。
- 跨簇分离:簇之间的间隔是否明显,是否存在明显的边界。
- 簇大小:各簇大小是否均衡,过大的簇可能影响结果稳定。
- 鲁棒性:K-means对异常值敏感,DBSCAN能自动识别噪声点。
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