ConsensusClusterPlus聚类分析时将distance定义为相关系数的代码
时间: 2024-04-17 18:26:25 浏览: 88
聚类分析代码
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在使用ConsensusClusterPlus进行聚类分析时,可以将distance定义为相关系数。下面是一个示例代码:
```R
library(ConsensusClusterPlus)
# 导入数据
data <- read.table("your_data.txt", header = TRUE)
# 计算相关系数矩阵
cor_matrix <- cor(data)
# 将相关系数矩阵作为输入进行聚类分析
result <- ConsensusClusterPlus(cor_matrix, distance = "correlation")
# 输出聚类结果
cluster <- result$consensusClass
# 打印每个样本的聚类标签
print(cluster)
```
在上面的代码中,我们首先导入数据,然后计算数据的相关系数矩阵。接下来,将相关系数矩阵作为输入传递给ConsensusClusterPlus函数,并设置distance参数为"correlation",表示使用相关系数作为距离度量。最后,输出聚类结果并打印每个样本的聚类标签。
请注意,上述代码仅为示例,你需要根据你的数据和具体需求进行适当的修改。
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