如何使用Python中的sklearn库对Iris(鸢尾花)数据集(如iris.arff.csv文件)进行主成分分析(PCA),并将结果显示为二维散点图?
时间: 2024-12-14 16:19:01 浏览: 6
鸢尾花数据_iris.arff.csv
在Python中,使用`sklearn`库对Iris数据集进行主成分分析(PCA)并绘制二维散点图的步骤如下:
1. **导入必要的库**:
```python
import pandas as pd
from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn.decomposition import PCA
import matplotlib.pyplot as plt
```
2. **加载数据**:
```python
data = pd.read_csv('iris.arff.csv') # 假设文件是CSV格式
X = data.iloc[:, :-1] # 提取特征数据
y = data.iloc[:, -1] # 提取目标变量
```
3. **加载Iris数据集**(如果数据不是CSV格式):
```python
if not os.path.exists('iris.arff.csv'):
iris = load_iris()
X = iris.data
y = iris.target
```
4. **主成分分析(PCA)**:
```python
pca = PCA(n_components=2) # 只保留前两个主成分
principal_components = pca.fit_transform(X)
```
5. **将结果绘制成二维散点图**:
```python
plt.figure(figsize=(8,6))
for i in range(len(iris.target_names)):
plt.scatter(principal_components[y == i, 0], principal_components[y == i, 1],
label=iris.target_names[i])
plt.xlabel('First Principal Component')
plt.ylabel('Second Principal Component')
plt.legend()
plt.title('PCA of Iris dataset')
plt.show()
```
这里我们选择了`n_components=2`,因为想要直观地显示二维空间中的数据分布。这将把高维数据降维到二维,并通过颜色或标记区分不同的类别。
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