R语言中 shapviz函数中需要设置哪些参数
时间: 2024-10-07 10:08:42 浏览: 34
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在R语言中,`shapley`库中的`shap.dependence.plot()`函数用于可视化特征对模型预测的影响,即SHAP (SHapley Additive exPlanations)值。它可以帮助我们理解单个特征如何影响模型决策。`shapviz`函数的主要参数包括:
1. `shap_values`: 这是Shapley值的结果,通常是由`shap.TreeExplainer`或`shap.LinearExplainer`等工具计算得出的。
2. `features`: 区分每个特征的标签或索引列表,对应于`shap_values`中的列。
3. `max_display`: 如果有大量特征,可以设置这个参数显示的最大解释变量数。默认是5,可根据需要调整。
4. `feature_names`: 特征名称,如果数据集有列名,提供方便理解。
5. `plot_type`: 可选参数,可以选择`dot`, `bar`, 或`force`图型,分别表示点状图、条形图和力导向图。
6. `color`: 设置颜色方案,如“blue”、“red”等,也可以自定义颜色映射。
7. `link`: 指定连续变量的链接函数,默认为线性,其他选项如`logit`或`identity`。
8. `alpha`: 控制图像透明度。
9. `show_all_features`: 是否显示所有特征的影响,对于复杂的模型可能会导致图形拥挤。
10. `...`: 其他可选参数,例如`max_contrib`: 最大贡献边的数量。
使用示例:
```r
library(shap)
explainer <- explain(model, data)
shap_values <- shap_values(explainer, new_data)
shapviz(shap_values, feature_names = names(data), plot_type = "bar")
```
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