gtsummary包中的tbl_summary函数怎么用
时间: 2023-11-24 12:40:49 浏览: 53
gtsummary包中的tbl_summary函数用于生成数据摘要表。以下是使用tbl_summary函数的步骤:
1. 首先,确保已经安装了gtsummary和dplyr包,并加载它们。
```
library(gtsummary)
library(dplyr)
```
2. 准备数据。将数据加载到R中,确保数据格式正确,例如将数值型变量转换为因子(如果需要)。
```
data <- mtcars
data$vs <- as.factor(data$vs)
data$am <- as.factor(data$am)
```
3. 使用tbl_summary函数生成数据摘要表。可以选择指定变量进行分组(如果需要)。
```
tbl <- tbl_summary(data, by = c("vs", "am"))
```
4. 可以使用add_p函数添加变量的p值信息。add_p函数默认使用t检验来计算p值。
```
tbl <- tbl %>% add_p()
```
5. 可以使用modify_caption函数修改表格的标题。
```
tbl <- tbl %>% modify_caption("**Table 1. 数据摘要表**")
```
6. 最后,使用tbl_summary函数生成的tbl对象可以通过print函数进行打印,也可以在RMarkdown或Shiny应用程序中使用。
```
print(tbl)
```
相关问题
tbl_summary
tbl_summary通常是指表格摘要或统计表格。它是对某个数据集或研究结果进行简洁而有效的概要呈现的一种方式。tbl_summary可以包含各种信息,比如样本数量、均值、中位数、方差、最小/最大值等统计指标。
tbl_summary可以用于不同领域的研究和报告中,比如医学研究、社会调查、市场研究等。在医学研究中,tbl_summary经常用于描述研究对象的基本特征,包括年龄、性别、疾病状况等。在社会调查中,tbl_summary可以汇总各类人口统计信息,比如教育水平、收入水平、就业状况等。在市场研究中,tbl_summary可以用来总结消费者对某种产品或服务的评价和偏好。
tbl_summary的好处是能够快速呈现数据集的关键特征,使读者能够一目了然地了解数据的背景和概况。它能够将复杂的数据转化为易读的、可理解的形式,为后续的分析和解读提供基础。同时,tbl_summary还能够帮助研究者和读者快速发现数据中的异常值或研究结果中的重要信息。
综上所述,tbl_summary是一种简洁而有效的统计表格,可用于快速概括数据集或研究结果的关键特征。它在不同领域的研究和报告中都有着广泛的应用。
gtsummary包中如何实现 Mann-Whitney U检验
gtsummary包中可以使用`add_stat()`函数来添加Mann-Whitney U检验的结果。具体步骤如下:
1. 使用`tbl_summary()`函数生成表格,并且指定需要进行Mann-Whitney U检验的两个变量。
```r
library(gtsummary)
data(trial)
tbl <- tbl_summary(trial,
missing = "no",
type = all_continuous() ~ "continuous2")
```
2. 使用`add_stat()`函数添加Mann-Whitney U检验的结果。需要指定`test`参数为`wilcox.test`,并且指定需要比较的两个变量。
```r
tbl %>% add_stat(
all_continuous() ~ "{wilcox.test(var1, var2) %>% format_pvalue()}",
test = list(~ wilcox.test(var1, var2)),
location = "footer"
)
```
其中,`all_continuous()`表示对所有连续变量进行操作,`location = "footer"`表示将统计结果添加在表格的底部。
这样,就可以在表格中添加Mann-Whitney U检验的结果了。