plink tped
时间: 2023-11-02 20:07:13 浏览: 267
plink.exe程序包
Plink软件中的tped文件是map/ped文件的转置版本,用于进行基因分析和相关性计算等操作。tped文件是二进制格式的,其中包含了基因型信息和位点信息。与map文件相比,tped文件不仅包含了位点信息,还包含了每个个体在特定位点上的两个等位基因。tped文件的主要优点是其比ped文件更加紧凑和高效。
在使用Plink软件时,可以通过运行相应的命令将map/ped文件转换为tped格式。具体的命令和参数取决于你的具体需求和数据类型。例如,你可以使用Plink的--recode命令来将map/ped文件转换为tped格式。
参考文献:
Plink files - Animal Genome. (n.d.). Retrieved November 15, 2021, from https://www.animalgenome.org/bioinfo/resources/manuals/plink_files
Formats - Plink 2.0 documentation. (n.d.). Retrieved November 15, 2021, from https://www.cog-genomics.org/plink/2.0/formats#ped
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