用R软件的shiny包进行cox生存预测的时候,在server中用survfit函数,就会提示错误:对比只适用于有两个或多于两个层次的因子。如果使用predict函数又会报错status找不到。这种情况怎么解决吗,怎么进行生存概率和生存时间的预测,并用shiny包进行互动展示。
时间: 2024-03-11 08:43:46 浏览: 193
baymedr_shiny_app:适用于R包baymedr的闪亮应用程序
这个问题可能是由于在survfit函数中使用了非因子变量导致的。survfit函数是用于生存分析的,需要输入的是因子型变量,而非因子型变量需要进行转换。您可以尝试使用as.factor()函数将非因子型变量转换为因子型变量,然后再使用survfit函数。如果您需要进行生存概率和生存时间的预测,可以使用predict函数,但在使用predict函数之前,需要先使用coxph函数来拟合Cox比例风险模型。关于status找不到的问题,您需要检查一下您的数据集中是否存在“status”这一列,并且这一列的名字是否正确。如果您需要使用shiny包进行互动展示,您可以使用shinydashboard包来创建一个漂亮的仪表盘,通过输入不同的参数来预测生存概率和生存时间,同时您还可以将预测结果以图表的形式展示出来。
阅读全文