ucsc使用：“ 在“Output”选项卡中，选择“exonFrames”、“exonStarts”和“exonEnds”等列，然后点击“get output”按钮。这将导出一个表格，其中包含所有外显子的起始和终止位置以及外显子的相对位置。”中output选项卡在哪里

UCSC指的是美国加州大学圣克鲁兹分校（University of California, Santa Cruz）的基因组浏览器（genome browser），在浏览器页面中，"Output"选项卡通常位于页面右上角，可以通过点击浏览器页面右上角的"Output"按钮来打开该选项卡。如果您在UCSC基因组浏览器中找不到"Output"选项卡，可以尝试查看页面的其他选项卡或者在浏览器页面上搜索"Output"关键词。

相关问题

用ucsc：在mouse mm10基因组中，以NCBI RefSeq基因注释为准，在chr8:122451619-122551999区间中包含几个基因？各个基因转录方向是怎样的？各个基因包含几个转录本？

可以使用UCSC的基因组浏览器进行查询和分析。

1. 首先进入UCSC基因组浏览器（https://genome.ucsc.edu/）。

2. 在搜索栏中选择“Mouse (mm10)”作为基因组版本，输入“chr8:122451619-122551999”作为搜索区间，点击“go”。

3. 在搜索结果页面中，点击“Genes”选项卡，选择“NCBI RefSeq”作为基因注释来源，点击“refresh tracks”更新结果。

4. 查看结果页面中的基因注释信息，可以发现该区间中包含3个基因，分别是：C8orf31、Ttc8、和Nrg1。它们的转录方向如下：

- C8orf31：转录方向为“-”（即反向链）
- Ttc8：转录方向为“-”
- Nrg1：转录方向为“+”（即正向链）

5. 点击每个基因的名称，可以进入该基因的详细注释页面。在该页面中，可以查看该基因包含的转录本数目。根据NCBI RefSeq注释，这些基因的转录本数目如下：

- C8orf31：包含1个转录本
- Ttc8：包含2个转录本
- Nrg1：包含6个转录本

因此，该区间中共包含9个转录本。

用ucsc：在mouse mm10基因组中，以NCBI RefSeq基因注释为准，基因Zc3h18包括几个转录本？在第几个外显子上存在exon skipping的选择性剪接现象？，叙述操作步骤

在UCSC Genome Browser中，按照以下步骤进行操作：

1. 打开UCSC Genome Browser网站：https://genome.ucsc.edu/
2. 点击页面左上方的"Genomes"，选择"Mouse (mm10)"作为基因组。
3. 点击页面左侧的"Tools"，选择"Table Browser"。
4. 在"Table"选项卡中，选择"NCBI RefSeq"作为数据集，并选择"refGene"作为表格。
5. 在"Region"选项卡中，输入"Zc3h18"作为基因名，并选择"gene"作为表格。
6. 在"Output"选项卡中，选择"exons"作为输出项，并勾选"exonStarts"和"exonEnds"。
7. 点击"get output"按钮，将获得Zc3h18基因的所有转录本及其外显子信息。
8. 找到Zc3h18基因的所有转录本，并查看它们的外显子信息。
9. 找到存在exon skipping的选择性剪接现象的外显子，并记录它在基因的第几个外显子上。