rdkit recap生成片段
时间: 2023-10-21 15:02:13 浏览: 166
RDKit Documentation Release 2019.09.1.pdf
RDKit Recap是一个开源的药物设计软件包,它包含了多种片段生成方法来生成化合物的片段。片段是化合物分子中的一部分,可以用来研究化合物的结构特征和属性。RDKit Recap可以通过分子的规则化(Standardize)、拆分(Fragment)和过滤(Filter)等步骤,将一个化合物分解成一系列的片段。
首先,RDKit Recap会对输入的化合物进行规则化处理,以确保化合物的完整性和一致性,并纠正一些常见的结构错误和问题。
然后,RDKit Recap会将化合物分解成多个片段。这些片段可以是环系统、带电原子、官能团等等。RDKit Recap使用了一系列的规则和算法来确定并生成这些片段。
最后,RDKit Recap会根据用户设定的过滤条件对生成的片段进行筛选和过滤。这些过滤条件可以是片段的大小、分子的性质等等。只有满足这些过滤条件的片段才会被保留下来。
RDKit Recap生成的片段可以用于药物设计、药物优化、药效团分析等各种化学研究和应用领域。它可以帮助研究人员理解和探索化合物的结构和性质,加速化合物的发现和优化过程。
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